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ubiome相似數據dada2處理探索4
時間 2020-07-05
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前面咱們探索了處理不能拼接的V4 PE150數據,首先雙向reads根據質量狀況分別切成120bp,而後使用dada2 R包進行了直接+10N拼接,生成ASV表,再分別使用dada2包和qiime2進行了物種註釋,基本上完成了一個最簡單的分析過程,這裏,使用比較流行的phyloseq包進行下多樣性分析。html 說實話,以前從沒有使用R進行過16S數據分析,通常認爲R速度慢些,並且不熟悉。這裏用了
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