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ubiome相似數據dada2處理探索5
時間 2020-07-05
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前面咱們探索了處理不能拼接的V4 PE150數據,首先雙向reads根據質量狀況分別切成120bp,而後使用dada2 R包進行了直接+10N拼接,生成ASV表,再分別使用dada2包,decipher包和qiime2進行了物種註釋,基本上完成了一個最簡單的分析過程。這裏填下本身以前挖的坑,比較一下這個含有348條序列的樣本,qiime2,dada2和的分類器哪一個效果更好。web 界門綱目科 只
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