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【一塊兒學生信】根據目標區域提取bam信息
時間 2020-02-12
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測序完成獲得的reads咱們會比對到參考基因組獲得bam文件,bam文件通常很大,不少時候咱們只須要提取部份內容。git 根據參考基因組位置提取 根據指定基因組區域的提取bam,可使用如下命令。github samtools samtools view -hb chr:start-end wgs.sort.bam > target.region.bam # 根據bed文件來提取 samtool
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