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【一塊兒學生信】根據reads名稱提取bam
時間 2020-02-12
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一塊兒學生信
根據
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bam
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上文(https://lipidong.blog.csdn.net/article/details/88975801) 提到了根據參考基因組的位置來提取bam信息, 根據基因組區域來提取實際上是比較容易的,即使沒有現成的軟件咱們將bam排序後,用awk也能夠快速提取,可是若是是根據reads名稱來提取就比較麻煩了,本身寫腳本或者用grep速度會比較慢,今天推薦用picard來操做。java jav
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