聚類之高斯混合模型(Gaussian Mixture Model)【轉】

k-means應該是原來級別的聚類方法了,這整理下一個使用後驗機率準確評測其精度的方法—高斯混合模型。算法

咱們談到了用 k-means 進行聚類的方法,此次咱們來講一下另外一個很流行的算法:Gaussian Mixture Model (GMM)。事實上,GMM 和 k-means 很像,不過 GMM 是學習出一些機率密度函數來(因此 GMM 除了用在 clustering 上以外,還常常被用於 density estimation ),簡單地說,k-means 的結果是每一個數據點被 assign 到其中某一個 cluster 了,而 GMM 則給出這些數據點被 assign 到每一個 cluster 的機率,又稱做 soft assignment 。dom

得出一個機率有不少好處,由於它的信息量比簡單的一個結果要多,好比,我能夠把這個機率轉換爲一個 score ,表示算法對本身得出的這個結果的把握。也許我能夠對同一個任務,用多個方法獲得結果,最後選取「把握」最大的那個結果;另外一個很常見的方法是在諸如疾病診斷之類的場所,機器對於那些很容易分辨的狀況(患病或者不患病的機率很高)能夠自動區分,而對於那種很難分辨的狀況,好比,49% 的機率患病,51% 的機率正常,若是僅僅簡單地使用 50% 的閾值將患者診斷爲「正常」的話,風險是很是大的,所以,在機器對本身的結果把握很小的狀況下,會「拒絕發表評論」,而把這個任務留給有經驗的醫生去解決。機器學習

廢話說了一堆,不過,在回到 GMM 以前,咱們再稍微扯幾句。咱們知道,無論是機器仍是人,學習的過程均可以看做是一種「概括」的過程,在概括的時候你須要有一些假設的前提條件,例如,當你被告知水裏遊的那個傢伙是魚以後,你使用「在一樣的地方生活的是同一種東西」這相似的假設,概括出「在水裏遊的都是魚」這樣一個結論。固然這個過程是徹底「本能」的,若是不仔細去想,你也不會了解本身是怎樣「認識魚」的。另外一個值得注意的地方是這樣的假設並不老是徹底正確的,甚至能夠說老是會有這樣那樣的缺陷的,所以你有可能會把蝦、龜、甚至是潛水員當作魚。也許你以爲能夠經過修改前提假設來解決這個問題,例如,基於「生活在一樣的地方而且穿着一樣衣服的是同一種東西」這個假設,你得出結論:在水裏有而且身上長有鱗片的是魚。但是這樣仍是有問題,由於有些沒有長鱗片的魚如今又被你排除在外了。函數

在這個問題上,機器學習面臨着和人同樣的問題,在機器學習中,一個學習算法也會有一個前提假設,這裏被稱做「概括偏執 (bias)」(bias 這個英文詞在機器學習和統計裏還有其餘許多的意思)。例如線性迴歸,目的是要找一個函數儘量好地擬合給定的數據點,它的概括偏執就是「知足要求的函數必須是線性函數」。一個沒有概括偏執的學習算法從某種意義上來講毫無用處,就像一個徹底沒有概括能力的人同樣,在第一次看到魚的時候有人告訴他那是魚,下次看到另外一條魚了,他並不知道那也是魚,由於兩條魚總有一些地方不同的,或者就算是同一條魚,在河裏不一樣的地方看到,或者只是看到的時間不同,也會被他認爲是不一樣的,由於他沒法概括,沒法提取主要矛盾、忽略次要因素,只好要求全部的條件都徹底同樣──然而哲學家已經告訴過咱們了:世界上不會有任何樣東西是徹底同樣的,因此這我的即便是有無比強悍的記憶力,也絕學不到任何一點知識。學習

這個問題在機器學習中稱做「過擬合 (Overfitting)」,例如前面的迴歸的問題,若是去掉「線性函數」這個概括偏執,由於對於 N 個點,咱們老是能夠構造一個 N-1 次多項式函數,讓它完美地穿過全部的這 N 個點,或者若是我用任何大於 N-1 次的多項式函數的話,我甚至能夠構造出無窮多個知足條件的函數出來。若是假定特定領域裏的問題所給定的數據個數老是有個上限的話,我能夠取一個足夠大的 N ,從而獲得一個(或者無窮多個)「超級函數」,可以 fit 這個領域內全部的問題。然而這個(或者這無窮多個)「超級函數」有用嗎?只要咱們注意到學習的目的(一般)不是解釋現有的事物,而是從中概括出知識,並能應用到新的事物上,結果就顯而易見了。ui

沒有概括偏執或者概括偏執太寬泛會致使 Overfitting ,然而另外一個極端──限制過大的概括偏執也是有問題的:若是數據自己並非線性的,強行用線性函數去作迴歸一般並不能獲得好結果。難點正在於在這之間尋找一個平衡點。不過人在這裏相對於(如今的)機器來講有一個很大的優點:人一般不會孤立地用某一個獨立的系統和模型去處理問題,一我的天天都會從各個來源獲取大量的信息,而且經過各類手段進行整合處理,概括所得的全部知識最終得以統一地存儲起來,並能有機地組合起來去解決特定的問題。這裏的「有機」這個詞頗有意思,搞理論的人總能提出各類各樣的模型,而且這些模型都有嚴格的理論基礎保證能達到指望的目的,然而絕大多數模型都會有那麼一些「參數」(例如 K-means 中的 k ),一般沒有理論來講明參數取哪一個值更好,而模型實際的效果卻一般和參數是否取到最優值有很大的關係,我以爲,在這裏「有機」不妨看做是全部模型的參數已經自動地取到了最優值。另外,雖然進展不大,可是人們也一直都指望在計算機領域也創建起一個統一的知識系統(例如語意網就是這樣一個嘗試)。atom

廢話終於說完了,回到 GMM 。按照咱們前面的討論,做爲一個流行的算法,GMM 確定有它本身的一個至關體面的概括偏執了。其實它的假設很是簡單,顧名思義,Gaussian Mixture Model ,就是假設數據服從 Mixture Gaussian Distribution ,換句話說,數據能夠看做是從數個 Gaussian Distribution 中生成出來的。實際上,咱們在 K-means 和 K-medoids 兩篇文章中用到的那個例子就是由三個 Gaussian 分佈從隨機選取出來的。實際上,從中心極限定理能夠看出,Gaussian 分佈(也叫作正態 (Normal) 分佈)這個假設實際上是比較合理的,除此以外,Gaussian 分佈在計算上也有一些很好的性質,因此,雖然咱們能夠用不一樣的分佈來隨意地構造 XX Mixture Model ,可是仍是 GMM 最爲流行。另外,Mixture Model 自己其實也是能夠變得任意複雜的,經過增長 Model 的個數,咱們能夠任意地逼近任何連續的機率密分佈。spa

每一個 GMM 由 K 個 Gaussian 分佈組成,每一個 Gaussian 稱爲一個「Component」,這些 Component 線性加成在一塊兒就組成了 GMM 的機率密度函數: .net

這裏寫圖片描述


根據上面的式子,若是咱們要從 GMM 的分佈中隨機地取一個點的話,實際上能夠分爲兩步:首先隨機地在這 K 個 Component 之中選一個,每一個 Component 被選中的機率實際上就是它的係數πkπk,選中了 Component 以後,再單獨地考慮從這個 Component 的分佈中選取一個點就能夠了──這裏已經回到了普通的 Gaussian 分佈,轉化爲了已知的問題。scala

 

那麼如何用 GMM 來作 clustering 呢?其實很簡單,如今咱們有了數據,假定它們是由 GMM 生成出來的,那麼咱們只要根據數據推出 GMM 的機率分佈來就能夠了,而後 GMM 的 K 個 Component 實際上就對應了 K 個 cluster 了。根據數據來推算機率密度一般被稱做 density estimation ,特別地,當咱們在已知(或假定)了機率密度函數的形式,而要估計其中的參數的過程被稱做「參數估計」。

如今假設咱們有 N 個數據點,並假設它們服從某個分佈(記做 p(x) ),如今要肯定裏面的一些參數的值,例如,在 GMM 中,咱們就須要肯定πkπk、μkμk 和 ΣkΣk 這些參數。 咱們的想法是,找到這樣一組參數,它所肯定的機率分佈生成這些給定的數據點的機率最大,而這個機率實際上就等於Ni=1p(xi)∏i=1Np(xi),咱們把這個乘積稱做似然函數 (Likelihood Function)。一般單個點的機率都很小,許多很小的數字相乘起來在計算機裏很容易形成浮點數下溢,所以咱們一般會對其取對數,把乘積變成加和Ni=1logp(xi)∑i=1Nlog⁡p(xi),獲得 log-likelihood function 。接下來咱們只要將這個函數最大化(一般的作法是求導並令導數等於零,而後解方程),亦即找到這樣一組參數值,它讓似然函數取得最大值,咱們就認爲這是最合適的參數,這樣就完成了參數估計的過程。

下面讓咱們來看一看 GMM 的 log-likelihood function :

 

 
i=1Nlog{k=1KπkN(xi|μk,Σk)}∑i=1Nlog⁡{∑k=1KπkN(xi|μk,Σk)}


因爲在對數函數裏面又有加和,咱們無法直接用求導解方程的辦法直接求得最大值。爲了解決這個問題,咱們採起以前從 GMM 中隨機選點的辦法:分紅兩步,實際上也就相似於 K-means 的兩步。 

 

  • 估計數據由每一個 Component 生成的機率(並非每一個 Component 被選中的機率):對於每一個數據 x_i 來講,它由第 k 個 Component 生成的機率爲 
     
    γ(i,k)=πkN(xi|μk,Σk)Kj=1πjN(xi|μj,Σj)γ(i,k)=πkN(xi|μk,Σk)∑j=1KπjN(xi|μj,Σj)

    因爲式子裏的μkΣkμk和Σk也是須要咱們估計的值,咱們採用迭代法,在計算 γ(i,k)γ(i,k)的時候咱們假定μkΣkμk和Σk均已知,咱們將取上一次迭代所得的值(或者初始值)。
  • 估計每一個 Component 的參數:如今咱們假設上一步中獲得的γ(i,k)γ(i,k)就是正確的「數據xixi 由 Component k 生成的機率」,亦能夠當作該 Component 在生成這個數據上所作的貢獻,或者說,咱們能夠看做xixi 這個值其中有 γ(i,k)xiγ(i,k)xi這部分是由 Component k 所生成的。集中考慮全部的數據點,如今實際上能夠看做 Component 生成了 γ(1,k)x1,,γ(N,k)xNγ(1,k)x1,…,γ(N,k)xN這些點。因爲每一個 Component 都是一個標準的 Gaussian 分佈,能夠很容易分佈求出最大似然所對應的參數值: 
     
    μkΣk=1Nki=1Nγ(i,k)xi=1Nki=1Nγ(i,k)(xiμk)(xiμk)Tμk=1Nk∑i=1Nγ(i,k)xiΣk=1Nk∑i=1Nγ(i,k)(xi−μk)(xi−μk)T

    其中Nk=Ni=1γ(i,k)Nk=∑i=1Nγ(i,k) ,而且 πkπk也瓜熟蒂落地能夠估計爲Nk/NNk/N 。

 

重複迭代前面兩步,直到似然函數的值收斂爲止。 
固然,上面給出的只是比較「直觀」的解釋,想看嚴格的推到過程的話,能夠參考 Pattern Recognition and Machine Learning 這本書的第九章。有了實際的步驟,再實現起來就很簡單了。Matlab 代碼以下:

(Update 2012.07.03:若是你直接把下面的代碼拿去運行了,碰到 covariance 矩陣 singular 的狀況,能夠參見這篇文章。)

function varargout = gmm(X, K_or_centroids) % ============================================================ % Expectation-Maximization iteration implementation of % Gaussian Mixture Model. % % PX = GMM(X, K_OR_CENTROIDS) % [PX MODEL] = GMM(X, K_OR_CENTROIDS) % % - X: N-by-D data matrix. % - K_OR_CENTROIDS: either K indicating the number of % components or a K-by-D matrix indicating the % choosing of the initial K centroids. % % - PX: N-by-K matrix indicating the probability of each % component generating each point. % - MODEL: a structure containing the parameters for a GMM: % MODEL.Miu: a K-by-D matrix. % MODEL.Sigma: a D-by-D-by-K matrix. % MODEL.Pi: a 1-by-K vector. % ============================================================ threshold = 1e-15; [N, D] = size(X); if isscalar(K_or_centroids) K = K_or_centroids; % randomly pick centroids rndp = randperm(N); centroids = X(rndp(1:K), :); else K = size(K_or_centroids, 1); centroids = K_or_centroids; end % initial values [pMiu pPi pSigma] = init_params(); Lprev = -inf; while true Px = calc_prob(); % new value for pGamma pGamma = Px .* repmat(pPi, N, 1); pGamma = pGamma ./ repmat(sum(pGamma, 2), 1, K); % new value for parameters of each Component Nk = sum(pGamma, 1); pMiu = diag(1./Nk) * pGamma' * X; pPi = Nk/N; for kk = 1:K Xshift = X-repmat(pMiu(kk, :), N, 1); pSigma(:, :, kk) = (Xshift' * ... (diag(pGamma(:, kk)) * Xshift)) / Nk(kk); end % check for convergence L = sum(log(Px*pPi')); if L-Lprev < threshold break; end Lprev = L; end if nargout == 1 varargout = {Px}; else model = []; model.Miu = pMiu; model.Sigma = pSigma; model.Pi = pPi; varargout = {Px, model}; end function [pMiu pPi pSigma] = init_params() pMiu = centroids; pPi = zeros(1, K); pSigma = zeros(D, D, K); % hard assign x to each centroids distmat = repmat(sum(X.*X, 2), 1, K) + ... repmat(sum(pMiu.*pMiu, 2)', N, 1) - ... 2*X*pMiu'; [dummy labels] = min(distmat, [], 2); for k=1:K Xk = X(labels == k, :); pPi(k) = size(Xk, 1)/N; pSigma(:, :, k) = cov(Xk); end end function Px = calc_prob() Px = zeros(N, K); for k = 1:K Xshift = X-repmat(pMiu(k, :), N, 1); inv_pSigma = inv(pSigma(:, :, k)); tmp = sum((Xshift*inv_pSigma) .* Xshift, 2); coef = (2*pi)^(-D/2) * sqrt(det(inv_pSigma)); Px(:, k) = coef * exp(-0.5*tmp); end end end
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函數返回的 Px 是一個 N×KN×K 的矩陣,對於每個 xixi ,咱們只要取該矩陣第 i 行中最大的那個機率值所對應的那個 Component 爲xixi所屬的 cluster 就能夠實現一個完整的聚類方法了。對於最開始的那個例子,GMM 給出的結果以下: 

這裏寫圖片描述

 

相對於以前 K-means 給出的結果,這裏的結果更好一些,左下角的比較稀疏的那個 cluster 有一些點跑得比較遠了。固然,由於這個問題本來就是徹底有 Mixture Gaussian Distribution 生成的數據,GMM (若是能求得全局最優解的話)顯然是能夠對這個問題作到的最好的建模。

另外,從上面的分析中咱們能夠看到 GMM 和 K-means 的迭代求解法其實很是類似(均可以追溯到 EM 算法,下一次會詳細介紹),所以也有和 K-means 一樣的問題──並不能保證老是能取到全局最優,若是運氣比較差,取到很差的初始值,就有可能獲得不好的結果。對於 K-means 的狀況,咱們一般是重複必定次數而後取最好的結果,不過 GMM 每一次迭代的計算量比 K-means 要大許多,一個更流行的作法是先用 K-means (已經重複並取最優值了)獲得一個粗略的結果,而後將其做爲初值(只要將 K-means 所得的 centroids 傳入 gmm 函數便可),再用 GMM 進行細緻迭代。

如咱們最開始所討論的,GMM 所得的結果(Px)不只僅是數據點的 label ,而包含了數據點標記爲每一個 label 的機率,不少時候這其實是很是有用的信息。最後,須要指出的是,GMM 自己只是一個模型,咱們這裏給出的迭代的辦法並非惟一的求解方法。感興趣的同窗能夠自行查找相關資料。

 

來源:https://blog.csdn.net/u014665013/article/details/78970184

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