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使用TCGAbiolinks進行甲基化和轉錄組數據的聯合分析
時間 2021-01-19
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歡迎關注」生信修煉手冊」! DNA甲基化作爲表觀遺傳的一種重要標記,在基因表達調控中發揮重要作用,已有研究表明,位於啓動子區的甲基化會抑制基因表達。結合甲基化數據和基因表達譜數據,可以更好的分析甲基化的調控功能。 通過TCGAbiolinks不僅僅可以對某種類型的數據進行分析,還可以進行多組學數據的聯合分析,DNA甲基化和基因表達譜數據的聯合分析過程如下 1. 甲基化芯片數據 以腎上腺皮質癌爲例,
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