JavaShuo
欄目
標籤
使用TCGAbiolinks分析TCGA中的表達譜數據
時間 2021-01-14
原文
原文鏈接
歡迎關注」生信修煉手冊」! 對於轉錄組數據而言,差異分析和富集分析是最核心的分析內容之一,通過TCGAbiolinks可以輕鬆實現TCGA表達譜數據的下載,差異分析,富集分析等功能,以乳腺癌的基因表達譜爲例,分析過程如下 1. 下載原始數據 由於TCGA中乳腺癌的樣本很多,所以只挑選了部分樣本來測試,下載的過程如下 2. 差異分析 詳細步驟如下 對數據進行預處理,根據樣本間的斯皮爾曼相關係數去除相
>>阅读原文<<
相關文章
1.
#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表達譜數據整合(二)
2.
TCGA數據庫的基因表達情況分析
3.
使用TCGAbiolinks進行生存分析
4.
一款表達譜數據分析的神器--CCLE--轉載
5.
用R包TCGA-Assembler下載TCGA數據
6.
使用OncoLnc進行TCGA生存分析
7.
GEPIA:TCGA和GTEx表達譜數據分析平臺
8.
使用TCGAbiolinks進行甲基化和轉錄組數據的聯合分析
9.
利用UCSC Xena做TCGA數據庫的生存曲線分析
10.
TCGA數據庫
更多相關文章...
•
在Spring中使用Redis
-
Redis教程
•
Redis中使用Lua語言
-
Redis教程
•
TiDB 在摩拜單車在線數據業務的應用和實踐
•
Flink 數據傳輸及反壓詳解
相關標籤/搜索
數據分析
tcga
光譜分析
Python數據分析
數據分析師
數據分析_excel
表達
使用正則表達式
譜分
數據表
MySQL教程
Redis教程
Hibernate教程
數據傳輸
數據庫
數據業務
0
分享到微博
分享到微信
分享到QQ
每日一句
每一个你不满意的现在,都有一个你没有努力的曾经。
最新文章
1.
CVPR 2020 論文大盤點-光流篇
2.
Photoshop教程_ps中怎麼載入圖案?PS圖案如何導入?
3.
org.pentaho.di.core.exception.KettleDatabaseException:Error occurred while trying to connect to the
4.
SonarQube Scanner execution execution Error --- Failed to upload report - 500: An error has occurred
5.
idea 導入源碼包
6.
python學習 day2——基礎學習
7.
3D將是頁遊市場新賽道?
8.
osg--交互
9.
OSG-交互
10.
Idea、spring boot 圖片(pgn顯示、jpg不顯示)解決方案
本站公眾號
歡迎關注本站公眾號,獲取更多信息
相關文章
1.
#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表達譜數據整合(二)
2.
TCGA數據庫的基因表達情況分析
3.
使用TCGAbiolinks進行生存分析
4.
一款表達譜數據分析的神器--CCLE--轉載
5.
用R包TCGA-Assembler下載TCGA數據
6.
使用OncoLnc進行TCGA生存分析
7.
GEPIA:TCGA和GTEx表達譜數據分析平臺
8.
使用TCGAbiolinks進行甲基化和轉錄組數據的聯合分析
9.
利用UCSC Xena做TCGA數據庫的生存曲線分析
10.
TCGA數據庫
>>更多相關文章<<