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使用TCGAbiolinks分析TCGA中的表達譜數據
時間 2021-01-14
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歡迎關注」生信修煉手冊」! 對於轉錄組數據而言,差異分析和富集分析是最核心的分析內容之一,通過TCGAbiolinks可以輕鬆實現TCGA表達譜數據的下載,差異分析,富集分析等功能,以乳腺癌的基因表達譜爲例,分析過程如下 1. 下載原始數據 由於TCGA中乳腺癌的樣本很多,所以只挑選了部分樣本來測試,下載的過程如下 2. 差異分析 詳細步驟如下 對數據進行預處理,根據樣本間的斯皮爾曼相關係數去除相
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