ChAMP 分析甲基化芯片數據-差異分析下篇

對於甲基化芯片的差異分析，除了有探針水平的差異分析，還有差異甲基化區域DMR分析。 差異甲基化區域的示意圖如下： 該圖片來自Bumphunter的文獻，圖中綠色矩形代表的就是一個差異甲基化區域。 A 圖代表的是甲基化位點的在cancer和normal 兩個group的分佈, 每組包含8個生物學重複；B 圖代表的是DMR 檢測的原理，在正負0.1的兩條紅線是自定義的差異閾值，而黑色的線是根據CpG位

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