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bsseq 進行差異甲基化分析
時間 2021-01-19
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bsseq 主要用來分析WGBS的數據, 安裝過程如下 source(「http://bioconductor.org/biocLite.R「) biocLite(「bsseq」) bsseq的分析主要包括以下4步: 讀取原始數據 BSmooth t-test檢驗 DMR 1. 讀取原始數據 bsseq要求的原始數據格式如下: 共6列數據,製表符分隔,每一行代表一個甲基化位點,前5列很好理解,描述
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