空間轉錄組第三講：圖像手動對齊

前面介紹Space Ranger的使用的時候有提到過，一種是自動對齊（只需要提供圖片文件），另外一種是手動對齊（除了需要提供圖片文件，還需要提供圖像組織位置跟spot對應信息的json文件）。今天來介紹一下10x空間轉錄組Visium 的圖像手動對齊。 Space Ranger管線使用 自動圖像檢測算法 來計算基準標記的位置，並找到組織的邊界。10x Genomics在各種各樣的H＆E圖像，組織和

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