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MACS:使用最廣泛的peak calling軟件之一
時間 2021-01-09
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歡迎關注」生信修煉手冊」! MACS全稱是Model-based Analysis of ChIP-Seq,是使用的最廣泛的peak calling軟件之一,其基本原理簡介如下 1. 預測測序reads與peak的偏倚距離 在chip_seq等數據中科學家發現在真實的結合位點兩側,正負鏈的測序深度分佈如下圖所示,對應峯值的中心距離peak中心有一定的偏移 MACS首先通過一個模型來評估真實的pea
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