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call peak的另一個軟件-----SICER
時間 2020-12-22
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說到ChIP-Seq數據的call peak,第一個想到的軟件肯定是大名鼎鼎的MACS2。MACS2比較適合call narrow peak,當然broad peak也是可以的。但是我課題的數據卻不適用於這個軟件,無奈之下我又嘗試了另一個軟件SICER。SICER適用於找出那些diffuse/broad peak,通過識別空間信號簇來尋找ChIP-enriched信號。(下面是原理,其實一知半
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