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如何使用MACS進行peak calling
時間 2021-01-15
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MACS2是peak calling最常用的工具。 callpeak用法 這是MACS2的主要功能,因爲MACS2的目的就是找peak,其他功能都是可有可無,唯獨callpeak不可取代。最簡單的用法就是 # 常規的peak calling macs2 callpeak -t ChIP.bam -c Control.bam -f BAM -g hs -n test -B -q 0.01 # 較寬的
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