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PPI網絡實戰:String加Cytoscape聯手挖掘PPI網絡
時間 2021-01-13
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歡迎關注」生信修煉手冊」! 在之前的文章中,我們提到利用網絡聚類算法可以從複雜的蛋白質網絡中挖掘蛋白複合體或者相應的功能模塊,其中MCODE算法是最常用的挖掘蛋白複合體的算法。 MCODE全稱molecular complex detection, 是最廣泛使用的挖掘蛋白複合體的算法之一,在cytoscape 軟件中提供了一個MCODE插件,可以方便的對網絡進行聚類。 cytoscape 是一個功
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