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PPI網絡實戰:String加Cytoscape聯手挖掘PPI網絡
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歡迎關注」生信修煉手冊」!算法 在以前的文章中,咱們提到利用網絡聚類算法能夠從複雜的蛋白質網絡中挖掘蛋白複合體或者相應的功能模塊,其中MCODE算法是最經常使用的挖掘蛋白複合體的算法。數據庫 MCODE全稱molecular complex detection, 是最普遍使用的挖掘蛋白複合體的算法之一,在cytoscape 軟件中提供了一個MCODE插件,能夠方便的對網絡進行聚類。微信 cytos
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