ChAMP 分析甲基化芯片數據-EpiMod篇

DNA甲基化會調控基因的表達水平，進而影響基因的相互作用。將基因的相互作用網絡和差異甲基化信息結合起來，基於那些甲基化水平發生差異的基因，從整個相互作用網絡挖掘出這些基因的相互作用模塊，這些模塊可以看是與樣本表型數據相關的基因集合，這種研究方式叫做Functional Epigenetic Modules(FEMs), 也叫做hotspots。 在ChAMP中，通過champ.EpiMod函數進行

>>阅读原文<<