python使用cuML訓練你的機器學習模型

做者|Khuyen Tran
編譯|VK
來源|Towards Data Science

動機

Sklearn是一個很好的庫，有各類機器學習模型，能夠用來訓練數據。可是若是你的數據很大，你可能須要很長時間來訓練你的數據，特別是當你用不一樣的超參數來尋找最佳模型時。

有沒有一種方法可使機器學習模型的訓練速度比使用Sklearn的速度快150倍？答案就是你可使用cuML。

下面的圖表比較了使用Sklearn的RandomForestClassifier和cuML的RandomForestClassifier訓練同一模型所需的時間。

cuML是一套快速的，GPU加速的機器學習算法，設計用於數據科學和分析任務。它的API相似於Sklearn的，這意味着你可使用訓練Sklearn模型的代碼來訓練cuML的模型。

from cuml.ensemble import RandomForestClassifier

clf = KNeighborsClassifier(n_neighbors=10)
clf.fit(X, y)

在本文中，我將比較使用不一樣模型的這兩個庫的性能。我還將演示如何增長顯卡，使得速度提升10倍。

安裝cuML

要安裝cuML，請按照Rapids頁面上的說明進行安裝。請確保在安裝庫以前檢查先決條件。你能夠安裝全部軟件包，也能夠只安裝cuML。若是你的計算機空間有限，我建議安裝cuDF和cuML。

雖然在不少狀況下，不須要安裝cuDF來使用cuML，可是cuDF是cuML的一個很好的補充，由於它是一個GPU數據幀。

確保選擇適合你計算機的選項。

建立數據

由於當有大量數據時，cuML一般比Sklearn更好，所以咱們將使用sklearn.datasets.

從sklearn導入數據集

from sklearn import datasets
X, y  = datasets.make_classification(n_samples=40000)

將數據類型轉換爲np.float32由於有些cuML模型要求輸入是np.float32.

X = X.astype(np.float32)
y = y.astype(np.float32)

支持向量機

咱們將建立用於訓練模型的函數。使用此函數將使咱們更容易比較不一樣的模型。

def train_data(model, X=X, y=y):
    clf = model
    clf.fit(X, y)

咱們使用iPython的magic命令%timeit運行每一個函數7次，取全部實驗的平均值。

from sklearn.svm import SVC 
from cuml.svm import SVC as SVC_gpu

clf_svc = SVC(kernel='poly', degree=2, gamma='auto', C=1)
sklearn_time_svc = %timeit -o train_data(clf_svc)

clf_svc = SVC_gpu(kernel='poly', degree=2, gamma='auto', C=1)
cuml_time_svc = %timeit -o train_data(clf_svc)

print(f"""Average time of sklearn's {clf_svc.__class__.__name__}""", sklearn_time_svc.average, 's')
print(f"""Average time of cuml's {clf_svc.__class__.__name__}""", cuml_time_svc.average, 's')

print('Ratio between sklearn and cuml is', sklearn_time_svc.average/cuml_time_svc.average)

Average time of sklearn's SVC 48.56009825014287 s
Average time of cuml's SVC 19.611496431714304 s
Ratio between sklearn and cuml is 2.476103668030909

cuML的SVC比sklearn的SVC快2.5倍！

讓咱們經過圖片來可視化它。咱們建立一個函數來繪製模型的速度。

!pip install cutecharts

import cutecharts.charts as ctc 

def plot(sklearn_time, cuml_time):

    chart = ctc.Bar('Sklearn vs cuml')
    chart.set_options(
        labels=['sklearn', 'cuml'],
        x_label='library',
        y_label='time (s)',
        )

    chart.add_series('time', data=[round(sklearn_time.average,2), round(cuml_time.average,2)])
    return chart

plot(sklearn_time_svc, cuml_time_svc).render_notebook()

更好的顯卡

因爲cuML的模型在運行大數據時比Sklearn的模型快，由於它們是用GPU訓練的，若是咱們將GPU的內存增長三倍會發生什麼？

在前面的比較中，我使用的是一臺搭載geforce2060的Alienware M15筆記本電腦和6.3gb的顯卡內存。

如今，我將使用一個帶有Quadro RTX 5000的Dell Precision 7740和17 GB的顯卡內存來測試GPU內存增長時的速度。

Average time of sklearn's SVC 35.791008955999914 s
Average time of cuml's SVC 1.9953700327142931 s
Ratio between sklearn and cuml is 17.93702840535976

當它在一個顯卡內存爲17gb的機器上訓練時，cuML的支持向量機比Sklearn的支持向量機快18倍！它的速度是筆記本電腦訓練速度的10倍，顯卡內存爲6.3gb。

這就是爲何若是咱們使用像cuML這樣的GPU加速庫。

隨機森林分類器

clf_rf = RandomForestClassifier(max_features=1.0,
                   n_estimators=40)
sklearn_time_rf = %timeit -o train_data(clf_rf)

clf_rf = RandomForestClassifier_gpu(max_features=1.0,
                   n_estimators=40)
cuml_time_rf = %timeit -o train_data(clf_rf)

print(f"""Average time of sklearn's {clf_rf.__class__.__name__}""", sklearn_time_rf.average, 's')
print(f"""Average time of cuml's {clf_rf.__class__.__name__}""", cuml_time_rf.average, 's')

print('Ratio between sklearn and cuml is', sklearn_time_rf.average/cuml_time_rf.average)

Average time of sklearn's RandomForestClassifier 29.824075075857113 s
Average time of cuml's RandomForestClassifier 0.49404465585715635 s
Ratio between sklearn and cuml is 60.3671646323408

cuML的RandomForestClassifier比Sklearn的RandomForestClassifier快60倍!若是訓練Sklearn的RandomForestClassifier須要30秒，那麼訓練cuML的RandomForestClassifier只須要不到半秒！

更好的顯卡

Average time of Sklearn's RandomForestClassifier 24.006061030143037 s
Average time of cuML's RandomForestClassifier 0.15141178591425808 s.
The ratio between Sklearn’s and cuML is 158.54816641379068

在個人戴爾Precision 7740筆記本電腦上訓練時，cuML的RandomForestClassifier比Sklearn的RandomForestClassifier快158倍！

最近鄰分類器

Average time of sklearn's KNeighborsClassifier 0.07836367340000508 s
Average time of cuml's KNeighborsClassifier 0.004251259535714585 s
Ratio between sklearn and cuml is 18.43304854518441

注：y軸上的20m表示20ms。

cuML的KNeighborsClassifier比Sklearn的KNeighborsClassifier快18倍。

更大的顯卡內存

Average time of sklearn's KNeighborsClassifier 0.07511190322854547 s
Average time of cuml's KNeighborsClassifier 0.0015137992111426033 s
Ratio between sklearn and cuml is 49.618141346401956

在個人戴爾Precision 7740筆記本電腦上訓練時，cuML的KNeighborsClassifier比Sklearn的KNeighborsClassifier快50倍。

總結

你能夠在這裏找到其餘比較的代碼。

如下兩個表總結了兩個庫之間不一樣模型的速度：

• Alienware M15-GeForce 2060和6.3 GB顯卡內存

index	sklearn(s)	cuml(s)	sklearn/cuml
SVC	50.24	23.69	2.121
RandomForestClassifier	29.82	0.443	67.32
KNeighborsClassifier	0.078	0.004	19.5
LinearRegression	0.005	0.006	0.8333
Ridge	0.021	0.006	3.5
KNeighborsRegressor	0.076	0.002	38

• Dell Precision 7740-Quadro RTX 5000和17 GB顯卡內存

index	sklearn(s)	cuml(s)	sklearn/cuml
SVC	35.79	1.995	17.94
RandomForestClassifier	24.01	0.151	159
KNeighborsClassifier	0.075	0.002	37.5
LinearRegression	0.006	0.002	3
Ridge	0.005	0.002	2.5
KNeighborsRegressor	0.069	0.001	69

至關使人印象深入，不是嗎？

結論

你剛剛瞭解了在cuML上訓練不一樣的模型與Sklearn相比有多快。若是使用Sklearn訓練你的模型須要很長時間，我強烈建議你嘗試一下cuML，由於與Sklearn的API相比，代碼沒有任何變化。

固然，若是庫使用GPU來執行像cuML這樣的代碼，那麼你擁有的顯卡越好，訓練的速度就越快。

有關其餘機器學習模型的詳細信息，請參閱cuML的文檔：https://docs.rapids.ai/api/cuml/stable/

原文連接：https://towardsdatascience.com/train-your-machine-learning-model-150x-faster-with-cuml-69d0768a047a

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