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#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表達譜數據整合(二)
時間 2019-12-07
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tcga
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mirna
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上期(#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表達譜數據整合)使用shell 對多樣本表達譜文件整合,實現方式是將1881個miRNA和425個樣本直接存入一個"awk二維表"而後輸出,所有在內存中運行,因此速度極快. 但shell中已經提供了專門整合文本的命令join,能夠用於兩個文本的合併.本期介紹join命令的語法以及使用join整合miRNA表達譜數據.shell 先從一個例子介紹j
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