JavaShuo
欄目
標籤
GATK - VQSR(Variant Quality Score Recalibration)
時間 2020-12-25
標籤
VQSR
二代測序分析
简体版
原文
原文鏈接
爲什麼WES的數據無法使用VQSR進行變異質控? 其實不只是WES,還包括很多小panel的數據,如果樣本量比較少的話基本都無法使用VQSR進行變異的質控。其原因就在VQSR的原理上。 VQSR的核心原理是利用機器學習算法構造一個區分「好」變異和「壞」變異的分類器。這個分類器在GATK中是通過GMM模型來構造的,它在構造的時候並不是盲目地使用所有數據來進行構造,而是挑出和已知的變異集合Overla
>>阅读原文<<
相關文章
1.
GATK之HaplotypeCaller
2.
How is Quality Score Calculated?
3.
GATK官方文檔翻譯-Data pre-processing for variant discovery
4.
Hard filters (by GATK)
5.
【轉】GATK使用方法詳解(包含bwa使用)
6.
Creating a universal SNP and small indel variant caller with deep neural networks理解
7.
Top 6 Refactoring Patterns to Help You Score 80% in Code Quality
8.
GATK --- wdl 語言
9.
GATK軟件介紹
10.
Image Quality Assessment,IQA and Video Quality Assessment,VQA
更多相關文章...
•
Web Quality - 無障礙(WAI)
-
網站品質教程
•
XSL-FO initial-property-set 對象
-
XSL-FO 教程
相關標籤/搜索
quality
variant
score
gatk
0
分享到微博
分享到微信
分享到QQ
每日一句
每一个你不满意的现在,都有一个你没有努力的曾经。
最新文章
1.
正確理解商業智能 BI 的價值所在
2.
解決梯度消失梯度爆炸強力推薦的一個算法-----LSTM(長短時記憶神經網絡)
3.
解決梯度消失梯度爆炸強力推薦的一個算法-----GRU(門控循環神經⽹絡)
4.
HDU4565
5.
算概率投硬幣
6.
密碼算法特性
7.
DICOMRT-DiTools:clouddicom源碼解析(1)
8.
HDU-6128
9.
計算機網絡知識點詳解(持續更新...)
10.
hods2896(AC自動機)
本站公眾號
歡迎關注本站公眾號,獲取更多信息
相關文章
1.
GATK之HaplotypeCaller
2.
How is Quality Score Calculated?
3.
GATK官方文檔翻譯-Data pre-processing for variant discovery
4.
Hard filters (by GATK)
5.
【轉】GATK使用方法詳解(包含bwa使用)
6.
Creating a universal SNP and small indel variant caller with deep neural networks理解
7.
Top 6 Refactoring Patterns to Help You Score 80% in Code Quality
8.
GATK --- wdl 語言
9.
GATK軟件介紹
10.
Image Quality Assessment,IQA and Video Quality Assessment,VQA
>>更多相關文章<<