JavaShuo
欄目
標籤
GATK - VQSR(Variant Quality Score Recalibration)
時間 2020-12-25
標籤
VQSR
二代測序分析
简体版
原文
原文鏈接
爲什麼WES的數據無法使用VQSR進行變異質控? 其實不只是WES,還包括很多小panel的數據,如果樣本量比較少的話基本都無法使用VQSR進行變異的質控。其原因就在VQSR的原理上。 VQSR的核心原理是利用機器學習算法構造一個區分「好」變異和「壞」變異的分類器。這個分類器在GATK中是通過GMM模型來構造的,它在構造的時候並不是盲目地使用所有數據來進行構造,而是挑出和已知的變異集合Overla
>>阅读原文<<
相關文章
1.
GATK之HaplotypeCaller
2.
How is Quality Score Calculated?
3.
GATK官方文檔翻譯-Data pre-processing for variant discovery
4.
Hard filters (by GATK)
5.
【轉】GATK使用方法詳解(包含bwa使用)
6.
Creating a universal SNP and small indel variant caller with deep neural networks理解
7.
Top 6 Refactoring Patterns to Help You Score 80% in Code Quality
8.
GATK --- wdl 語言
9.
GATK軟件介紹
10.
Image Quality Assessment,IQA and Video Quality Assessment,VQA
更多相關文章...
•
Web Quality - 無障礙(WAI)
-
網站品質教程
•
XSL-FO initial-property-set 對象
-
XSL-FO 教程
相關標籤/搜索
quality
variant
score
gatk
0
分享到微博
分享到微信
分享到QQ
每日一句
每一个你不满意的现在,都有一个你没有努力的曾经。
最新文章
1.
android 以太網和wifi共存
2.
沒那麼神祕,三分鐘學會人工智能
3.
k8s 如何 Failover?- 每天5分鐘玩轉 Docker 容器技術(127)
4.
安裝mysql時一直卡在starting the server這一位置,解決方案
5.
秋招總結指南之「性能調優」:MySQL+Tomcat+JVM,還怕面試官的轟炸?
6.
布隆過濾器瞭解
7.
深入lambda表達式,從入門到放棄
8.
中間件-Nginx從入門到放棄。
9.
BAT必備500道面試題:設計模式+開源框架+併發編程+微服務等免費領取!
10.
求職面試寶典:從面試官的角度,給你分享一些面試經驗
本站公眾號
歡迎關注本站公眾號,獲取更多信息
相關文章
1.
GATK之HaplotypeCaller
2.
How is Quality Score Calculated?
3.
GATK官方文檔翻譯-Data pre-processing for variant discovery
4.
Hard filters (by GATK)
5.
【轉】GATK使用方法詳解(包含bwa使用)
6.
Creating a universal SNP and small indel variant caller with deep neural networks理解
7.
Top 6 Refactoring Patterns to Help You Score 80% in Code Quality
8.
GATK --- wdl 語言
9.
GATK軟件介紹
10.
Image Quality Assessment,IQA and Video Quality Assessment,VQA
>>更多相關文章<<