生物信息學入門 GEO芯片數據差別表達分析時是否須要log2以及標準化的問題

GEO中的Series Matrix File(s)一般是通過了標準化和對數轉換的數據。但不全是。在實際應用的時候須要根據狀況判斷一下。對於芯片數據，可能做者將.cel的文件處理成未標準化的數據直接上傳。通常來講，在判斷counts是否須要從新標準化以及是否須要log2時，能夠根據數值大小粗略估計。ide 若是表達丰度的數值在50之內，一般是通過log2轉化的。若是數字在幾百幾千，則是未經轉化的。

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