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MACS -- Model-based Analtsis of ChiP-Seq 原理
時間 2021-01-12
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MACS基本原理 TF在基因組上的結合其實是一個隨機過程,基因組的每個位置其實都有機會結合某個TF,只是概率不一樣,說白了,peak出現的位置,是TF結合的熱點,而peak-calling就是爲了找到這些熱點。 如何定義熱點呢?通俗地講,熱點是這樣一些位置,這些位置多次被測得的read所覆蓋(我們測的是一個細胞羣體,read出現次數多,說明該位置被TF結合的機率大)。那麼,read
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