bismark 識別甲基化位點-比對篇

bismark  軟件根據序列的比對情況就可以識別甲基化位點，首先需要對基因組建立索引，建好索引之後，就可以開始比對了。 我用的軟件自帶的單端測序的數據集進行測試， 命令如下 bismark hg19_bismark_db/  test_data.fastq -o test 第一個參數爲bismark_genome_preparation命令構建的基因組索引所在的目錄，第二個參數爲需要比對的序列，

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