分子動力學模擬-軌跡處理-求平均結構

利用amber的cpptraj求動力學軌跡的平均結構（蛋白核酸複合物）： 先導入軌跡 然後有下面三種疊合（align）方式 rms first mass @所有蛋白核酸複合物的骨架原子 rms first rms first mass @所有核酸骨架原子（沒有蛋白的骨架原子）圖中紅色複合物構象（對應方法1）最扁，深藍色的（方法2）次之，淺藍色（方法3）的是正常的，說明三種疊合方式裏面方法3最爲可信

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