咱們常常接觸到的聚類分析,通常都是數值聚類,一種常見的作法是同時提取 N 種特徵,將它們放在一塊兒組成一個 N 維向量,從而獲得一個從原始數據集合到 N 維向量空間的映射——你老是須要顯式地或者隱式地完成這樣一個過程,而後基於某種規則進行分類,在該規則下,同組分類具備最大的類似性。
假設咱們提取到原始數據的集合爲(x1, x2, …, xn),而且每一個xi爲d維的向量,K-means聚類的目的就是,在給定分類組數k(k ≤ n)值的條件下,將原始數據分紅k類 S = {S1, S2, …, Sk},在數值模型上,即對如下表達式求最小值: \underset{\mathbf{S}} {\operatorname{arg\,min}} \sum_{i=1}^{k} \sum_{\mathbf x_j \in S_i} \left\| \mathbf x_j - \boldsymbol\mu_i \right\|^2 這裏μi 表示分類Si 的平均值。
那麼在計算機編程中,其又是如何實現的呢?其算法步驟通常以下:
一、從D中隨機取k個元素,做爲k個簇的各自的中心。
二、分別計算剩下的元素到k個簇中心的相異度,將這些元素分別劃歸到相異度最低的簇。相異度通常用歐氏距離或者馬氏距離來運算,距離越小,說明兩者之間越類似。
三、根據聚類結果,從新計算k個簇各自的中心,計算方法是取簇中全部元素各自維度的算術平均數。
四、將D中所有元素按照新的中心從新聚類。
五、重複第4步,直到聚類結果再也不變化。
六、將結果輸出。
在數據挖掘中,K-Means算法是一種cluster analysis的算法,其主要是來計算數據彙集的算法,主要經過不斷地取離種子點最近均值的算法。前端
問題
K-Means算法主要解決的問題以下圖所示。咱們能夠看到,在圖的左邊有一些點,咱們用肉眼能夠看出來有四個點羣,可是咱們怎麼經過計算機程序找出這幾個點羣來呢?因而就出現了咱們的K-Means算法(Wikipedia連接)python
K-Means要解決的問題web
算法概要算法
這個算法其實很簡單,以下圖所示: 數據庫
從上圖中,咱們能夠看到,A,B,C,D,E是五個在圖中點。而灰色的點是咱們的種子點,也就是咱們用來找點羣的點。有兩個種子點,因此K=2。apache
而後,K-Means的算法以下:編程
- 隨機在圖中取K(這裏K=2)個種子點。
- 而後對圖中的全部點求到這K個種子點的距離,假如點Pi離種子點Si最近,那麼Pi屬於Si點羣。(上圖中,咱們能夠看到A,B屬於上面的種子點,C,D,E屬於下面中部的種子點)
- 接下來,咱們要移動種子點到屬於他的「點羣」的中心。(見圖上的第三步)
- 而後重複第2)和第3)步,直到,種子點沒有移動(咱們能夠看到圖中的第四步上面的種子點聚合了A,B,C,下面的種子點聚合了D,E)。
這個算法很簡單,可是有些細節我要提一下,求距離的公式我不說了,你們有初中畢業水平的人都應該知道怎麼算的。我重點想說一下「求點羣中心的算法」。api
求距離即相異度的算法
1)Minkowski Distance公式——λ能夠隨意取值,能夠是負數,也能夠是正數,或是無窮大。數組
2)Euclidean Distance公式——也就是第一個公式λ=2的狀況
3)CityBlock Distance公式——也就是第一個公式λ=1的狀況
這三個公式的求中心點有一些不同的地方,咱們看下圖(對於第一個λ在0-1之間)。
(1)Minkowski Distance (2)Euclidean Distance (3) CityBlock Distance
上面這幾個圖的大意是他們是怎麼個逼近中心的,第一個圖以星形的方式,第二個圖以同心圓的方式,第三個圖以菱形的方式。
K-Means的演示
若是你以」K Means Demo「爲關鍵字到Google裏查你能夠查到不少演示。這裏推薦一個演示:http://home.dei.polimi.it/matteucc/Clustering/tutorial_html/AppletKM.html
操做是,鼠標左鍵是初始化點,右鍵初始化「種子點」,而後勾選「Show History」能夠看到一步一步的迭代。
注:這個演示的連接也有一個不錯的K Means Tutorial。
K-Means++算法
K-Means主要有兩個最重大的缺陷——都和初始值有關:
- K是事先給定的,這個K值的選定是很是難以估計的。不少時候,事先並不知道給定的數據集應該分紅多少個類別才最合適。(ISODATA算法經過類的自動合併和分裂,獲得較爲合理的類型數目K)
- K-Means算法須要用初始隨機種子點來搞,這個隨機種子點過重要,不一樣的隨機種子點會有獲得徹底不一樣的結果。(K-Means++算法能夠用來解決這個問題,其能夠有效地選擇初始點)
我在這裏重點說一下K-Means++算法步驟:
- 先從咱們的數據庫隨機挑個隨機點當「種子點」。
- 對於每一個點,咱們都計算其和最近的一個「種子點」的距離D(x)並保存在一個數組裏,而後把這些距離加起來獲得Sum(D(x))。
- 而後,再取一個隨機值,用權重的方式來取計算下一個「種子點」。這個算法的實現是,先取一個能落在Sum(D(x))中的隨機值Random,而後用Random -= D(x),直到其<=0,此時的點就是下一個「種子點」。
- 重複第(2)和第(3)步直到全部的K個種子點都被選出來。
- 進行K-Means算法。
相關的代碼你能夠在這裏找到「implement the K-means++ algorithm」(牆)另,Apache的通用數據學庫也實現了這一算法
K-Means算法應用
看到這裏,你會說,K-Means算法看來很簡單,並且好像就是在玩座標點,沒什麼真實用處。並且,這個算法缺陷不少,還不如人工呢。是的,前面的例子只是玩二維座標點,的確沒什麼意思。可是你想一下下面的幾個問題:
1)若是不是二維的,是多維的,如5維的,那麼,就只能用計算機來計算了。
2)二維座標點的X,Y 座標,實際上是一種向量,是一種數學抽象。現實世界中不少屬性是能夠抽象成向量的,好比,咱們的年齡,咱們的喜愛,咱們的商品,等等,能抽象成向量的目的就是可讓計算機知道某兩個屬性間的距離。如:咱們認爲,18歲的人離24歲的人的距離要比離12歲的距離要近,鞋子這個商品離衣服這個商品的距離要比電腦要近,等等。
只要能把現實世界的物體的屬性抽象成向量,就能夠用K-Means算法來歸類了。
在《k均值聚類(K-means)》 這篇文章中舉了一個很不錯的應用例子,做者用亞洲15支足球隊的2005年到1010年的戰績作了一個向量表,而後用K-Means把球隊歸類,得出了下面的結果,呵呵。
- 亞洲一流:日本,韓國,伊朗,沙特
- 亞洲二流:烏茲別克斯坦,巴林,朝鮮
- 亞洲三流:中國,伊拉克,卡塔爾,阿聯酋,泰國,越南,阿曼,印尼
其實,這樣的業務例子還有不少,好比,分析一個公司的客戶分類,這樣能夠對不一樣的客戶使用不一樣的商業策略,或是電子商務中分析商品類似度,歸類商品,從而可使用一些不一樣的銷售策略,等等。
最後給一個挺好的算法的幻燈片:http://www.cs.cmu.edu/~guestrin/Class/10701-S07/Slides/clustering.pdf
下面是個人MATLAB代碼,效果不是特別好,可能須要改進,由於找中心的方式有好多種,這種方式可能會出現最終找不到最好的中心點的狀況:
主函數:
另外,MATLAB中有自帶的kmeans函數,能夠直接使用:
K-means聚類算法採用的是將N*P的矩陣X劃分爲K個類,使得類內對象之間的距離最大,而類之間的距離最小。
使用方法:
Idx=Kmeans(X,K)
[Idx,C]=Kmeans(X,K)
[Idc,C,sumD]=Kmeans(X,K)
[Idx,C,sumD,D]=Kmeans(X,K)
各輸入輸出參數介紹:
X---N*P的數據矩陣
K---表示將X劃分爲幾類,爲整數
Idx---N*1的向量,存儲的是每一個點的聚類標號
C---K*P的矩陣,存儲的是K個聚類質心位置
sumD---1*K的和向量,存儲的是類內全部點與該類質心點距離之和
D---N*K的矩陣,存儲的是每一個點與全部質心的距離
[┈]=Kmeans(┈,’Param1’,’Val1’,’Param2’,’Val2’,┈)
其中參數Param一、Param2等,主要能夠設置爲以下:
一、’Distance’---距離測度
‘sqEuclidean’---歐氏距離
‘cityblock’---絕對偏差和,又稱L1
‘cosine’---針對向量
‘correlation’---針對有時序關係的值
‘Hamming’---只針對二進制數據
二、’Start’---初始質心位置選擇方法
‘sample’---從X中隨機選取K個質心點
‘uniform’---根據X的分佈範圍均勻的隨機生成K個質心
‘cluster’---初始聚類階段隨機選取10%的X的子樣本(此方法初始使用’sample’方法)
Matrix提供一K*P的矩陣,做爲初始質心位置集合
三、’Replicates’---聚類重複次數,爲整數
使用案例:
data= 5.0 3.5 1.3 0.3 -1 5.5 2.6 4.4 1.2 0 6.7 3.1 5.6 2.4 1 5.0 3.3 1.4 0.2 -1 5.9 3.0 5.1 1.8 1 5.8 2.6 4.0 1.2 0
[Idx,C,sumD,D]=Kmeans(data,3,’dist’,’sqEuclidean’,’rep’,4)
運行結果:
Idx = 1 2 3 1 3 2
C = 5.0000 3.4000 1.3500 0.2500 -1.0000 5.6500 2.6000 4.2000 1.2000 0 6.3000 3.0500 5.3500 2.1000 1.0000
sumD = 0.0300 0.1250 0.6300
D = 0.0150 11.4525 25.5350 12.0950 0.0625 3.5550 29.6650 5.7525 0.3150 0.0150 10.7525 24.9650 21.4350 2.3925 0.3150 10.2050 0.0625 4.0850
另外這個連接裏面講kmeans和kmeans++都很是好,還有MATLAB和python的代碼:http://www.jb51.net/article/49395.htm,看完了這個裏面的內容,kmeans和kmeans++ 的MATLAB和python實現就都懂了,強力推薦
下面是python中實現kmeans++的程序,在以前給的鏈接裏也有:
from math import pi, sin, cos from collections import namedtuple from random import random, choice from copy import copy try: import psyco psyco.full() except ImportError: pass FLOAT_MAX = 1e100 class Point: __slots__ = ["x", "y", "group"] def __init__(self, x=0.0, y=0.0, group=0): self.x, self.y, self.group = x, y, group def generate_points(npoints, radius): points = [Point() for _ in xrange(npoints)] # note: this is not a uniform 2-d distribution for p in points: r = random() * radius ang = random() * 2 * pi p.x = r * cos(ang) p.y = r * sin(ang) return points def nearest_cluster_center(point, cluster_centers): """Distance and index of the closest cluster center""" def sqr_distance_2D(a, b): return (a.x - b.x) ** 2 + (a.y - b.y) ** 2 min_index = point.group min_dist = FLOAT_MAX for i, cc in enumerate(cluster_centers): d = sqr_distance_2D(cc, point) if min_dist > d: min_dist = d min_index = i return (min_index, min_dist) def kpp(points, cluster_centers): cluster_centers[0] = copy(choice(points)) d = [0.0 for _ in xrange(len(points))] for i in xrange(1, len(cluster_centers)): sum = 0 for j, p in enumerate(points): d[j] = nearest_cluster_center(p, cluster_centers[:i])[1] sum += d[j] sum *= random() for j, di in enumerate(d): sum -= di if sum > 0: continue cluster_centers[i] = copy(points[j]) break for p in points: p.group = nearest_cluster_center(p, cluster_centers)[0] def lloyd(points, nclusters): cluster_centers = [Point() for _ in