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基於單細胞測序數據構建細胞狀態轉換軌跡(cell trajectory)方法總結
時間 2021-01-12
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細胞狀態轉換軌跡構建示意圖(Trapnell et al. Nature Biotechnology, 2014) 在各種生物系統中,細胞都會展現出一系列的不同狀態(如基因表達的動態變化等),這些狀態(state)之間會按照一定的時間順序轉換。最典型的比如細胞的分化過程,從不成熟的細胞逐漸分化爲成熟細胞。此外,細胞在受到外界刺激或擾動時,細胞內基因的表達也可能發生一系列的變化,從而呈現出一系列狀態
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