LocusZoom圖幾乎是GWAS文章的必備圖形之一，其主要做用是能夠快速可視化GWAS找出來的信號在基因組的具體信息：好比周圍有沒有高度連鎖的位點，高度連鎖的位點是否也顯著。
下面是locuszoom的示例圖：spa
下面具體講講如何實現Locuszoom的繪製blog
一、進入Locuszoom的主頁class
http://locuszoom.org/變量
二、進入Locuszoom的主頁後，點擊single plot可視化
三、按以下圖操做sso
第一步：上傳關聯分析結果的文件，plink格式的話是assoc.logistic或者assoc.linear。注意：這個文件必須是隻含SNP位點的GWAS結果，要把協變量的結果去除掉。im
第二步：選擇P值所在列的名稱，以Plink格式爲例，P值所在列的名稱爲P，也能夠點擊右方的PLINK dataimg
第三步：同第二步的設置，填寫SNP所在的列的名稱。di
四、指定展現的區域，三選一，能夠是SNP，也能夠是基因，也能夠是區域。文件
五、選擇你所研究的羣體的基因組版本（hg18/hg19）
EUR表示歐洲，ASN表示亞洲，AMR表示美洲，AFR表示非洲。
六、最後，點擊Plot data，而後就等着收圖了。