如何快速評估16S rRNA基因引物的覆蓋率及特異性

背景 無論是在進行細菌、古菌高通量測序前，還是細菌、古菌qPCR前，最糾結的問題永遠是引物選擇。評估引物效果最重要的兩個指標是覆蓋率（coverage）和特異性（specificity）。簡單講，覆蓋率就是指目標引物能捕獲現有數據庫中靶序列的比例，比如，共有100種細菌的不同16S rRNA基因序列，某引物能擴增出其中的90種，那麼該引物的覆蓋率就是90%；特異性是指目標引物是否只靶標某特定類羣，

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