Microbiome: 16S rRNA基因拷貝數應該被校正嗎?

摘要: 16SrRNA基因是微生物生態學中應用最廣泛的標記基因,通常根據16S測序結果來估計微生物羣落中細菌和古菌的比例。然而由於不同生物體含有不同的16S基因拷貝數(gene copy numbers, GCNs),更大GCNs的分支往往會在測序中得到更多的序列,從而使得結果的相對丰度高於實際值。近來,一些基於測序基因組來預測GCNs的方法陸續被開發出來,這些方法使用了系統發育的方法以糾正前述偏
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