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動態編程之序列比對:Needleman-Wunsch 算法和Smith-Waterman算法
時間 2021-01-21
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1. 加分規則 S(a,b) = 10 (a=b) S(a,b) = -3(a!=b) S(a,b) = -5(a='_' or b='_') 通常DNA和RNA,Protein都有打分矩陣,Protein常用打分矩陣BLOSUM62 2. 動態規劃算法: 全局比對算法Needleman-Wunsch思路:從第一個到最後一個,一個個比,一條序列比個遍,然後得出最優解 example: 局部比對Sm
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