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序列比對(二)——Needleman-Wunsch算法之仿射罰分
時間 2020-12-30
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原創: hxj7 關於全局比對Needleman-Wunsch算法的介紹及線性罰分的實現代碼請參考序列比對(一)全局比對Needleman-Wunsch算法。 概念引用如下: 線性罰分,即penalty=g*d,其中g爲空位長度,d爲一個空位的罰分。 仿射型罰分,即penalty=d+(g-1)*e, 其中g爲連續空位的長度,d爲連續空位中第一個空位的罰分,e爲連續空位中第2個及以後空位的罰分。
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