【HDU - 1560】DNA sequence (dfs+回溯)

DNA sequence

直接中文了html

題目描述node

21世紀是生物科技飛速發展的時代。咱們都知道基因是由DNA組成的,而DNA的基本組成單位是A,C,G,T。在現代生物分子計算中,如何找到DNA之間的最長公共子序列是一個基礎性問題。 可是咱們的問題不是那麼簡單:如今咱們給定了數個DNA序列,請你構造出一個最短的DNA序列,使得全部咱們給定的DNA序列都是它的子序列。 例如,給定"ACGT","ATGC","CGTT","CAGT",你能夠構造的一個最短序列爲"ACAGTGCT",可是須要注意的是,這並非此問題的惟一解。ios

輸入spa

第一行含有一個數t,表明數據組數。 每組數據的第一行是一個數n,表明給定的DNA序列數量;接下來的n行每行一個字符串s,表明給定的n個DNA序列。 1<=n<=8,1<=|s|<=5.net

輸出code

對於每一組數據,輸出一行中含有一個數,表明知足條件的最短序列的長度。htm

樣例輸入blog

1
4
ACGT
ATGC
CGTT
CAGT

樣例輸出ci

8

題目連接字符串

https://vjudge.net/problem/HDU-1560

 

給出N個DNA序列,要求出一個包含這n個序列的最短序列是多長,直接dfs吧

 

AC代碼

 

#include <iostream> #include <cstdio> #include <fstream> #include <algorithm> #include <cmath> #include <deque> #include <vector> #include <queue> #include <string> #include <cstring> #include <map> #include <stack> #include <set> #include <sstream>
#define IOS ios_base::sync_with_stdio(0); cin.tie(0);
#define Mod 1000000007
#define eps 1e-6
#define ll long long
#define INF 0x3f3f3f3f
#define MEM(x,y) memset(x,y,sizeof(x))
#define Maxn 10
using namespace std; int pos[Maxn];//pos[i] 第i個序列正在使用第幾個位置
int T,n; int deep;//本身構造的DNA序列最小長度
char c[10] = "ACGT"; struct node { char ch[Maxn];      //DNA的組成
    int len;     //DNA長度
}; node a[Maxn];//a[i] 第i個DNA序列
int init()//預估長度
{ int ans=0; for(int i=0;i<n;i++)//總長度-正在使用的位置=剩下還沒用的位置 即預計長度
        ans=max(ans,a[i].len-pos[i]); return ans; } int dfs(int step) { if(step+init()>deep)//預計長度+當前長度>構造DNA序列的最小長度
        return 0; if(init()==0)//預計長度爲0,即已完成
        return 1; int pre[Maxn];//先將pos保存起來,一會回溯要用
    for(int i=0;i<4;i++) { int f=0; for(int j=0;j<n;j++)//保存pos
            pre[j]=pos[j]; for(int j=0;j<n;j++)//當前這位符合,則該串的位置日後移一位
 { if(a[j].ch[pos[j]]==c[i]) { f=1; pos[j]++; } } if(f) { if(dfs(step+1))//有符合的,則往下搜索
                return 1; for(int j=0;j<n;j++)//回溯
                pos[j]=pre[j]; } } return 0; } int main() { cin>>T; while(T--) { deep=0;//本身構造的DNA序列最小長度
        cin>>n; for(int i=0;i<n;i++)//存值
 { cin>>a[i].ch; a[i].len=strlen(a[i].ch); deep=max(deep,a[i].len); pos[i]=0; } while(1) { if(dfs(0)) break; deep++; } cout<<deep<<endl; } return 0; }

 

原文出處:https://www.cnblogs.com/sky-stars/p/11219615.html

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