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轉錄組測序多少生物重複合適?2個?3個?48個?
時間 2021-01-19
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2016年英國鄧迪大學的Geoffrey J Barton教授在RNA發表一篇文章專門評估這一問題。作者對野生型和snf2突變型酵母樣品分別測序了48個生物學重複;質控後,野生型樣品保留42個生物學重複,突變型樣品剩餘44個生物學重複。 在控制假陽性率爲0.05的標準下,用所有可用生物重複計算出的差異基因定義爲該差異基因鑑定工具的金標準差異基因集。 作者評估了11個常用的差異基因分析工具,性能最好
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