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「BioNano系列」混合組裝時的衝突應該如何手動解決
時間 2021-01-22
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「BioNano系列」光學圖譜混合組裝應該怎麼做? 中的第二步是非常關鍵的一步,因爲這一步是要發現組裝中的錯誤,提高組裝的準確性。 比如說下面就是我運行某個項目的輸出日誌,提示出現了18個BNG衝突,47個NGS衝突。 識別衝突 基礎篇 Hybrid Scaffold流程如何定義衝突? 衝突的本質就是光學圖譜和物理圖譜上的標記存在過多無法匹配的情況。具體來說,AssignAlignType.pl統
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