WDL學習

最近想把GATK流程化，方便後續工做。看到WDL+Cromwell的方法仍是比較方便的。並且後續GATK出來的best practice也是按照WDL寫的。就至關因而學習了。這裏記錄3個用的可能比較多的例子，具體的可見官網。java case2. 編寫一個多步驟（multi-step）流程 例子數據下載 這個任務是要分開從haplotypeCaller獲得的SNP和indel。web Workfl

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