RNA-seq中的基因表達量計算和表達差別分析

差別分析的步驟： 1）比對； 2） read count計算； 3） read count的歸一化； 4）差別表達分析；算法 背景知識： 1）比對： 普通比對： BWA，SOAP 開大GAP比對：Tophat（Bowtie2）； 2） Read count(多重比對的問題）： 丟棄 平均分配 利用Unique region估計並從新分配 表達量計算的本質 目標基因表達量相對參照系表達量的數值。 參

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