Pandas之旅(二): 有關數據清理的點點滴滴

數據清洗

你們好,這一期我將爲你們帶來個人pandas學習心得第二期:數據清理。這一步很是重要,通常在獲取數據源以後,咱們緊接着就要開始這一步,以便爲了以後的各類操做,簡單來講,咱們的目標就是讓數據看起來賞心悅目,規規矩矩的,因此咱們會對原始的dataframe作一些必要的美容,包括規範命名,去除異常值,從新選擇合適的index啊,處理缺失值,統一列的命名等等。python

這一期我會和你們分享一些比較好用常見的清洗方法。首先仍是讓咱們來簡單看一下本文將會用到的數據源:git

  • property_data.csv 這是一個超小型的房地產行業的數據集,你們會在文章最後找到下載地址。

這篇文章我會從如下幾個方面來和你們分享個人心得體會:github

  1. 有關缺失值的處理
  2. 有關列的處理
  3. 設置Index
  4. 源碼及數據下載地址

1.有關缺失值的處理

這裏咱們會用到 property_data.csv這個數據集,在開始處理缺失值以前,咱們能夠先話一分鐘仔細想一想,爲何實際生活中的數據歷來是不完整的,緣由基本有幾個方面:數據庫

  • 用戶忘記填寫字段
  • 從舊數據庫手動傳輸時數據丟失
  • 代碼中有bug
  • 用戶不填寫非必須字段(好比註冊的時候)

由於這些緣由,我每次在處理missing value的時候都會問本身兩個基礎問題:segmentfault

  1. 數據集每一列有什麼特色?
  2. 咱們想要在處理後獲得什麼類型的數據(int,float,string,boolean)?

帶着這些疑問,咱們能夠開始了,首先讓咱們簡單讀取一下數據,利用head函數看看前5行,若是你還對pandas的基礎知識有疑問,能夠看看我上一篇文章:Pandas之旅(一): 讓咱們把基礎知識一次擼完,申精幹貨函數

import pandas as pd
import numpy as np
import os
os.chdir("F:\\Python教程\\segmentfault\\pandas_share\\Pandas之旅_02 數據清洗")
# Read csv file into a pandas dataframe
df = pd.read_csv("property_data.csv")

# Take a look at the first few rows
df.head()
PID ST_NUM ST_NAME OWN_OCCUPIED NUM_BEDROOMS NUM_BATH SQ_FT
0 100001000.0 104.0 PUTNAM Y 3 1 1000
1 100002000.0 197.0 LEXINGTON N 3 1.5 --
2 100003000.0 NaN LEXINGTON N NaN 1 850
3 100004000.0 201.0 BERKELEY 12 1 NaN 700
4 NaN 203.0 BERKELEY Y 3 2 1600

如今讓咱們看看數據的一些關鍵列是什麼:學習

  • ST_NUM:街道號碼
  • ST_NAME: 街道名稱
  • OWN_OCCUPIED: 是否用於自住
  • NUM_BEDROOMS:臥室數量
  • SQ_FT:面積

這裏能夠給你們普及點房地產知識,有的時候房屋用途被明確規定,好比有的房產寫的是"owner occupied only ")意思是說若是你買了,那這個房子會成爲你的主要住所,不能用於出租之類的,簡單理解就是自住測試

因此如今我能夠自問自答第一個問題:數據集每一列有什麼特色?spa

  • ST_NUM:float或int ...
  • ST_NAME:string
  • OWN_OCCUPIED:string ... Y(「是」)或N(「否」)
  • NUM_BEDROOMS:float或int,數字類型
  • SQ_FT:float或int,數字類型

1.1 規範的缺失值標記

如今讓咱們關注ST_NUM這一列:code

# Looking at the ST_NUM column
df['ST_NUM']
0    104.0
1    197.0
2      NaN
3    201.0
4    203.0
5    207.0
6      NaN
7    213.0
8    215.0
Name: ST_NUM, dtype: float64

若是想查看該列的缺失值狀況,咱們能夠利用isnull()方法,若是出現缺失值,會返回True,反之返回false

df['ST_NUM'].isnull()
0    False
1    False
2     True
3    False
4    False
5    False
6     True
7    False
8    False
Name: ST_NUM, dtype: bool

可是其實若是咱們打開csv文件,你會發現第3行是空白,還有一行在該列顯示的是NA,因此結論已經有了:在pandas裏表示缺省值的符號及時NA,換句話說,若是咱們要表示缺省值,標準寫法是NA

clipboard.png

1.2 不規範的缺失值標記

一樣的,這回讓咱們關注一下NUM_BEDROOMS這一列,咱們發現出現了4種類型的表達缺省值的標記:

  • n/a
  • NA
  • na

clipboard.png

經過剛纔的實踐,咱們已經肯定NA是pandas能夠識別的,那麼其餘的符號呢,如今讓咱們來測試一下

df['NUM_BEDROOMS']
0      3
1      3
2    NaN
3      1
4      3
5    NaN
6      2
7      1
8     na
Name: NUM_BEDROOMS, dtype: object
df['NUM_BEDROOMS'].isnull()
0    False
1    False
2     True
3    False
4    False
5     True
6    False
7    False
8    False
Name: NUM_BEDROOMS, dtype: bool

能夠看到pandas識別了n/a 和NA兩種符號,可是接下來咱們要考慮一個問題,假設你是房地產公司的地區總經理,你每週會收到不一樣地區的負責人提交的表格,
這些人中有的喜歡用--表示空白值,有的人喜歡用na,那應該怎麼辦?

最簡單的方式就是將全部表示空白值的符號統一放在list中,讓後讓pandas一次性識別:

# Making a list of missing value types
missing_values =  ["na", "--"]
df = pd.read_csv("property_data.csv", na_values = missing_values)

如今咱們來看看到底發生了什麼?

df
PID ST_NUM ST_NAME OWN_OCCUPIED NUM_BEDROOMS NUM_BATH SQ_FT
0 100001000.0 104.0 PUTNAM Y 3.0 1 1000.0
1 100002000.0 197.0 LEXINGTON N 3.0 1.5 NaN
2 100003000.0 NaN LEXINGTON N NaN 1 850.0
3 100004000.0 201.0 BERKELEY 12 1.0 NaN 700.0
4 NaN 203.0 BERKELEY Y 3.0 2 1600.0
5 100006000.0 207.0 BERKELEY Y NaN 1 800.0
6 100007000.0 NaN WASHINGTON NaN 2.0 HURLEY 950.0
7 100008000.0 213.0 TREMONT Y 1.0 1 NaN
8 100009000.0 215.0 TREMONT Y NaN 2 1800.0

咱們能夠發現只要missing_value中記錄的表達空白值的符號,所有變成了規整的NaN

1.3 類型不一致的異常值

剛剛咱們已經簡單瞭解了在pandas中如何處理缺失值的,還有一種狀況,讓咱們來看OWN_OCCUPIED這一列,這一列的答案只能是Y,N 可是咱們發現數據集意外地出現了12,屬於類型不對稱

clipboard.png

df['OWN_OCCUPIED'].isnull()
0    False
1    False
2    False
3    False
4    False
5    False
6     True
7    False
8    False
Name: OWN_OCCUPIED, dtype: bool

如今咱們發現12是異常值,由於它是類型錯誤,因此咱們能夠簡單經過下面這個方法來檢測,

# Detecting numbers 
cnt=0
for row in df['OWN_OCCUPIED']:
    try:
        int(row)
        df.loc[cnt, 'OWN_OCCUPIED']=np.nan
    except ValueError:
        pass
    cnt+=1

咱們這裏的策略是:

  • 循環遍歷OWN_OCCUPIED列
  • 嘗試將條目轉換爲整數
  • 若是條目能夠更改成整數,請輸入缺失值
  • 若是數字不能是整數,咱們知道它是一個字符串,因此繼續

這樣咱們會把OWN_OCCUPIED這一列中全部類型不對的值轉化爲NaN,如今來看結果:

df['OWN_OCCUPIED']
0      Y
1      N
2      N
3    NaN
4      Y
5      Y
6    NaN
7      Y
8      Y
Name: OWN_OCCUPIED, dtype: object

1.4 彙總缺失值

pandas提供了更爲簡潔的方式,可讓咱們總體瞭解全部column的空值:

df.isnull().sum()
PID             1
ST_NUM          2
ST_NAME         0
OWN_OCCUPIED    2
NUM_BEDROOMS    3
NUM_BATH        1
SQ_FT           2
dtype: int64

或者若是咱們只想知道數據是否存在空值,那麼可使用如下的命令:

# Any missing values?
df.isnull().values.any()
True

1.5 替換缺失值

若是咱們想要替換掉缺失值,能夠用fillna方法

# Replace missing values with a number
df['ST_NUM'].fillna(125, inplace=True)

或者咱們能夠經過準肯定位來替換缺失值:

# Location based replacement
df.loc[2,'ST_NUM'] = 125

替換缺失值的一種很是常見的方法是使用中位數:

# Replace using median 
median = df['NUM_BEDROOMS'].median()
df['NUM_BEDROOMS'].fillna(median, inplace=True)
df
PID ST_NUM ST_NAME OWN_OCCUPIED NUM_BEDROOMS NUM_BATH SQ_FT
0 100001000.0 104.0 PUTNAM Y 3.0 1 1000.0
1 100002000.0 197.0 LEXINGTON N 3.0 1.5 NaN
2 100003000.0 125.0 LEXINGTON N 2.5 1 850.0
3 100004000.0 201.0 BERKELEY NaN 1.0 NaN 700.0
4 NaN 203.0 BERKELEY Y 3.0 2 1600.0
5 100006000.0 207.0 BERKELEY Y 2.5 1 800.0
6 100007000.0 125.0 WASHINGTON NaN 2.0 HURLEY 950.0
7 100008000.0 213.0 TREMONT Y 1.0 1 NaN
8 100009000.0 215.0 TREMONT Y 2.5 2 1800.0

2. 有關列的處理

2.1 統一修改列名

如今假設由於一些需求,須要咱們統一修改列名,把列名改成小寫,咱們能夠結合列表推導式輕易實現

df.rename(str.lower, axis='columns',inplace =True)
df.columns
Index(['pid', 'st_num', 'st_name', 'own_occupied', 'num_bedrooms', 'num_bath',
       'sq_ft'],
      dtype='object')

或者須要把列名中的_改成-:

new_cols = [c.replace("_","-") for c in df.columns]
change_dict =dict(zip(df.columns,new_cols))
df.rename(columns=change_dict,inplace=True)
df
pid st-num st-name own-occupied num-bedrooms num-bath sq-ft
0 100001000.0 104.0 PUTNAM Y 3.0 1 1000.0
1 100002000.0 197.0 LEXINGTON N 3.0 1.5 NaN
2 100003000.0 125.0 LEXINGTON N 2.5 1 850.0
3 100004000.0 201.0 BERKELEY NaN 1.0 NaN 700.0
4 NaN 203.0 BERKELEY Y 3.0 2 1600.0
5 100006000.0 207.0 BERKELEY Y 2.5 1 800.0
6 100007000.0 125.0 WASHINGTON NaN 2.0 HURLEY 950.0
7 100008000.0 213.0 TREMONT Y 1.0 1 NaN
8 100009000.0 215.0 TREMONT Y 2.5 2 1800.0

這裏我沒有寫的精簡一些,反而是複雜了,主要是想讓你們回憶起以前我分享的dict使用技巧中的內容,注意這裏inplace=True,致使的結果是咱們的的確確修改了df全部的列名

2.1 根據需求新增列

假如目前咱們須要新增一列,根據房屋面積大小來賦值,咱們先隨意把缺失值補上:

df['sq-ft'].fillna('0.0')
0    1000
1     0.0
2     850
3     700
4    1600
5     800
6     950
7     0.0
8    1800
Name: sq-ft, dtype: object

而後新建一列rank來根據房屋面積大小賦值S=small,M=medium,B=big:

df["rank"]= pd.cut(df['sq-ft'], [0, 800, 1600, np.inf], labels=("S","M","B"))
df
pid st-num st-name own-occupied num-bedrooms num-bath sq-ft rank
0 100001000.0 104.0 PUTNAM Y 3.0 1 1000.0 M
1 100002000.0 197.0 LEXINGTON N 3.0 1.5 NaN NaN
2 100003000.0 125.0 LEXINGTON N 2.5 1 850.0 M
3 100004000.0 201.0 BERKELEY NaN 1.0 NaN 700.0 S
4 NaN 203.0 BERKELEY Y 3.0 2 1600.0 M
5 100006000.0 207.0 BERKELEY Y 2.5 1 800.0 S
6 100007000.0 125.0 WASHINGTON NaN 2.0 HURLEY 950.0 M
7 100008000.0 213.0 TREMONT Y 1.0 1 NaN NaN
8 100009000.0 215.0 TREMONT Y 2.5 2 1800.0 B

具體實現方法咱們以後會說,這裏主要是用到了pandas的cut方法,很是便捷

3. 設置Index

在許多狀況下,使用數據的惟一值標識字段做爲其索引是有幫助的。這裏可能咱們的數據不太合適,所以咱們先僞造一列Fake_Index來模擬真實場景中的真正索引

df["Fake_Index"]=["A00"+str(i) for i in range(len(df))]
df
pid st-num st-name own-occupied num-bedrooms num-bath sq-ft rank Fake_Index
0 100001000.0 104.0 PUTNAM Y 3.0 1 1000.0 M A000
1 100002000.0 197.0 LEXINGTON N 3.0 1.5 NaN NaN A001
2 100003000.0 125.0 LEXINGTON N 2.5 1 850.0 M A002
3 100004000.0 201.0 BERKELEY NaN 1.0 NaN 700.0 S A003
4 NaN 203.0 BERKELEY Y 3.0 2 1600.0 M A004
5 100006000.0 207.0 BERKELEY Y 2.5 1 800.0 S A005
6 100007000.0 125.0 WASHINGTON NaN 2.0 HURLEY 950.0 M A006
7 100008000.0 213.0 TREMONT Y 1.0 1 NaN NaN A007
8 100009000.0 215.0 TREMONT Y 2.5 2 1800.0 B A008

如今咱們添加的最後一列很是像真正的房屋Id了,讓咱們來看看這個僞造的索引是否是惟一值,能夠利用is_unique來檢驗:

df.Fake_Index.is_unique
True

沒有問題,如今咱們能夠放心地把這列設置爲咱們真正的索引:

df = df.set_index('Fake_Index')
df
pid st-num st-name own-occupied num-bedrooms num-bath sq-ft rank
Fake_Index
A000 100001000.0 104.0 PUTNAM Y 3.0 1 1000.0 M
A001 100002000.0 197.0 LEXINGTON N 3.0 1.5 NaN NaN
A002 100003000.0 125.0 LEXINGTON N 2.5 1 850.0 M
A003 100004000.0 201.0 BERKELEY NaN 1.0 NaN 700.0 S
A004 NaN 203.0 BERKELEY Y 3.0 2 1600.0 M
A005 100006000.0 207.0 BERKELEY Y 2.5 1 800.0 S
A006 100007000.0 125.0 WASHINGTON NaN 2.0 HURLEY 950.0 M
A007 100008000.0 213.0 TREMONT Y 1.0 1 NaN NaN
A008 100009000.0 215.0 TREMONT Y 2.5 2 1800.0 B

如今對數據的操做容易多了,咱們不少事情能夠經過索引完成:

#  根據索引名稱切片
df['A000':'A003']
pid st-num st-name own-occupied num-bedrooms num-bath sq-ft rank
Fake_Index
A000 100001000.0 104.0 PUTNAM Y 3.0 1 1000.0 M
A001 100002000.0 197.0 LEXINGTON N 3.0 1.5 NaN NaN
A002 100003000.0 125.0 LEXINGTON N 2.5 1 850.0 M
A003 100004000.0 201.0 BERKELEY NaN 1.0 NaN 700.0 S
#  根據索引位置切片

df.iloc[1:3, 0:3]
pid st-num st-name
Fake_Index
A001 100002000.0 197.0 LEXINGTON
A002 100003000.0 125.0 LEXINGTON
# 定位到具體元素
df.iloc[1,2]
'LEXINGTON'

總結

我把這一期的ipynb文件和py文件放到了GIthub上,你們若是想要下載能夠點擊下面的連接:

這一期先講到這裏,但願你們可以繼續支持我,完結,撒花

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