這與主成分分析有點類似。app
0. 基本思想
主成分分析(PCA)是把原始有相關性變量,線性組合出無關的變量(投影),以利用主成分變量進行更加有效的分析。
而典型相關分析(CCA)的思想是:less分析自變量組 X = [x1,x2,x3…xp],因變量組 Y = [y1,y2,y3…yq] 之間的相關性。(注意這裏X的每個自變量x1是個列向量,表明有多個觀測值)。dom
若是採用傳統的相關分析,只要求X的每個變量與Y的每個變量的相關係數,從而組成相關係數矩陣 R = [rij]p*q ,rij表示第i個自變量xi與第j個因變量yj之間的相關係數。ide
然而,這是有缺陷的:只粗暴的考慮了X與Y的關係,卻忽略了X自變量之間也可能有相關關係,Y因變量之間亦如此。函數
解決的方法相似於主成分分析,咱們能夠把X提取出主成分,Y也提取出主成分,從而X、Y內部線性不相關了,這樣利用主成分研究X與Y之間相關性就解決了上述缺點。ui
1. 典型相關分析spa典型相關分析:3d
假設code
自變量組:X = [x1,x2,x3…xp]orm
因變量組:Y = [y1,y2,y3…yq]
注意,xi與yj都是相同維度的列向量。
要求
分析X與Y之間的相關性
2 直觀描述
首先在X中找出線性組合u1, 在Y中找出線性組合v1,使得 r(u1,v1)達到最大。
其次,在X中找第二個線性組合u2,Y中找第二個線性組合v2,要求使得u2與u1線性不相關,v2與v1線性不相關,而且: r(u2,v2)達到次大。
繼續。直到兩組變量之間的相關性被提取完畢。
3 數學描述
數學描述:
線性組合獲得的變量稱做典型變量。
4. 典型相關模型的分析須要分析原始變量與典型變量之間的相關性。
原始變量xi與典型變量uj之間的相關性爲:
式中,α是典型變量係數。
同理可求得原始變量xi與典型變量vj、yi與vj、yi與uj之間的相關係數。
建模時能夠列出這四個相關係數表格。
進而,咱們要對典型變量對各組原始變量解釋能力作分析,由於原始變量-->典型變量畢竟會有信息的損失。
Def:
其中,ρ(ui,xk) 是指原始變量xk與電影變量ui之間的相關係數。
注:
1)這個解釋能力是指,原始變量—>典型變量後,某個典型變量 ui 對原始變量<x1,x2,…xp>的解釋能力。由於若是採用比較少的典型變量,就會有更多的信息損失,這與PCA分析中主成分貢獻率相似。
2) 計算方法是:某個典型變量ui與全部xk(k=1 to p)的相關係數的平方和,再除以變量個數。這是方差比例。
咱們還要進行典型相關係數的檢驗。
這一步是建模必須的。
計算典型相關係數用到的是,X與X之間的協方差矩陣、X與Y之間的協方差矩陣、Y與Y之間的協方差矩陣。而這些協方差矩陣實際上是未知的,咱們只是用一些樣本對整體進行了近似。這個近似是有偏差的,須要進行有關的假設檢驗。
即:總體檢驗:檢驗X與Y之間的協方差矩陣是否爲0。如果0,則顯然X與Y不相關。不然X與Y具備相關性,即說明至少第一對典型變量之間的相關性顯著。
部分檢驗:檢驗部分典型相關係數爲0的檢驗:也就是第k對典型相關變量之間相關關係不顯著。
下面進行檢驗:
1)總體檢驗
2)部分整體典型相關係數爲零的檢驗
5 Summary:典型相關分析步驟
步驟以下:
設標準化後,X、Y增廣陣爲Z:
step1:計算原始變量X、Y增廣陣的相關係數矩陣R,而且剖分爲:
,其中,R11是X的協方差矩陣,R12是X與Y的協方差矩陣。
step2:求典型相關係數以及典型變量。
step3:進行典型相關係數λi的顯著性檢驗。有總體檢驗與部分檢驗,詳情見上。
step4:典型結構與典型冗餘分析。
這實際上是計算:
典型結構分析:其實就是X組原始變量被ui解釋分方差比例,Y組原始變量被vi解釋的方差比例
典型冗餘分析:其實就是X組原始變量被vi解釋分方差比例,Y組原始變量被ui解釋的方差比例
6. MATLAB實現。
MATLAB進行典型相關分析命令:
先查看一下Matlab help命令解釋:
canoncorr Canonical correlation analysis. [A,B] = canoncorr(X,Y) computes the sample canonical coefficients for the N-by-P1 and N-by-P2 data matrices X and Y. X and Y must have the same number of observations (rows) but can have different numbers of variables (cols). A and B are P1-by-D and P2-by-D matrices, where D = min(rank(X),rank(Y)). The jth columns of A and B contain the canonical coefficients, i.e. the linear combination of variables making up the jth canonical variable for X and Y, respectively. Columns of A and B are scaled to make COV(U) and COV(V) (see below) the identity matrix. If X or Y are less than full rank, canoncorr gives a warning and returns zeros in the rows of A or B corresponding to dependent columns of X or Y. [A,B,R] = canoncorr(X,Y) returns the 1-by-D vector R containing the sample canonical correlations. The jth element of R is the correlation between the jth columns of U and V (see below). [A,B,R,U,V] = canoncorr(X,Y) returns the canonical variables, also known as scores, in the N-by-D matrices U and V. U and V are computed as U = (X - repmat(mean(X),N,1))*A and V = (Y - repmat(mean(Y),N,1))*B. [A,B,R,U,V,STATS] = canoncorr(X,Y) returns a structure containing information relating to the sequence of D null hypotheses H0_K, that the (K+1)st through Dth correlations are all zero, for K = 0:(D-1). STATS contains seven fields, each a 1-by-D vector with elements corresponding to values of K: Wilks: Wilks' lambda (likelihood ratio) statistic chisq: Bartlett's approximate chi-squared statistic for H0_K, with Lawley's modification pChisq: the right-tail significance level for CHISQ F: Rao's approximate F statistic for H0_K pF: the right-tail significance level for F df1: the degrees of freedom for the chi-squared statistic, also the numerator degrees of freedom for the F statistic df2: the denominator degrees of freedom for the F statistic Example: load carbig; X = [Displacement Horsepower Weight Acceleration MPG]; nans = sum(isnan(X),2) > 0; [A B r U V] = canoncorr(X(~nans,1:3), X(~nans,4:5)); plot(U(:,1),V(:,1),'.'); xlabel('0.0025*Disp + 0.020*HP - 0.000025*Wgt'); ylabel('-0.17*Accel + -0.092*MPG') See also pca, manova1.
典型相關分析函數:[a,b,r,u,v,stats] = cononcorr(x,y):
param:
x:原始變量x矩陣,每列一個自變量指標,第i列是 xi 的樣本值
y:原始變量y矩陣,每列一個因變量指標,第j列是 yj 的樣本值
return:
a:自變量x的典型相關變量係數矩陣,每列是一組係數。
列數爲典型相關變量數
b:因變量y的典型相關變量係數矩陣,每列是一個係數
r: 典型相關係數。即第一對<u1,v1>之間的相關係數、第二對<u2,v2>之間的相關係數…
u:對於X的典型相關變量的值
v:對於Y的典型相關變量的值
stats:假設檢驗的值<詳細用一下就知道了>
也可使用MATLAB按照原理直接編寫程序,一個實現的例子以下:
實現程序:
這個典型相關係數表中,第一列0.5537是第<u1,v1>的相關係數。