amber中使用TIP4P水模型參數文件的生成

TIP4P水模型在特定情況下會使用於分子動力學模擬之中，同時，本文只以TIP4P爲例介紹非TIP3P水模型如何通過ambertools的leap模塊構建參數文件。主要參照Amber2016 Reference Manual中3.5章節Solvents所介紹，給出一個tleap.in腳本樣式，如下圖： 必須注意：使用leap產生的參數最好不要更換機器，實踐證明，使用A機器生成參數而使用B機器進行後續

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