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chipBase:轉錄因子調控網絡數據
時間 2021-01-11
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歡迎關注」生信修煉手冊」! chipBase收集來自GEO,ENCODE數據庫中的chip_seq數據,通過對這些原始數據進行分析,致力於構建各種轉錄因子與非編碼RNA, 蛋白編碼基因之間的調控網絡,網址如下 http://rna.sysu.edu.cn/chipbase/ 數據庫構建的流程如下 首先對來自10個物種一萬多個樣本的chip_seq數據進行分析,通過peak caling得到轉錄因子
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