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蛋白-小分子對接(含同源建模)
時間 2021-01-21
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1.項目說明 採用同源模建方法構建單鏈抗體(以下簡稱「抗體」)的三維結構,通過分子對接方法預測化合物的結合模式(圖 1)。 圖1.化合物兩種構型的化學結構 2.計算方法 本研究採用的計算方法簡述如下(詳見《計算方法》文檔): A.採用在線工具PIGSPro預測抗體的三維結構,通過分子動力學模擬優化結構; B.採用在線工具POCASA 1.1預測優化的抗體結構上潛在的結合位點; C.採用DOCK 6
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