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蛋白質同源建模的十個技巧
時間 2021-01-12
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目錄 前言 文章內容 一、文章介紹 1.目的 2.背景 二、十個建模技巧 1.模板選擇 2.閱讀發表的相應模板三維結構的文章 3.去除不必要的元素、溶劑、配體和離子 4.優化3D結構,如果氫丟失要補回氫 5.留意比對過程的gaps 6. 進行loop建模時要考慮loop大小以及殘基組成 7.在進行計算分析前,進行結構最小化是必不可少的 8.使用多種策略進行三維結構的驗證和評估 9.考慮氨基酸質子化
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