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R語言 ConsensusClusterPlus 肯定最佳K值
時間 2020-07-25
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用PCA的方法肯定最佳聚類數 M 爲計算出共識矩陣 Fn = ecdf(M[lower.tri(M)]) 提取出共識矩陣下三角的數據,而後將用ecdf 方法生成擬合曲線 計算0.1到0.9之間的面積 面積最小值對應K爲最佳Kweb Kvec = 2:maxK x1 = 0.1; x2 = 0.9 # threshold defining the intermediate sub-interval
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