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使用ccle下載細胞系IC50數據
時間 2021-01-21
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ccle數據下載 進入ccle網站 點擊data,然後選擇自己需要的數據類型然後選擇下載,這裏我選擇了counts數據 下載得到的數據: 下載的數據的第一行(版本信息)和第二行(基因數和樣本數)記得去掉後才能讀入到R中 往下拉下載藥物信息,用來對應細胞系的藥物響應信息 下載的數據: ccle網站默認IC50值是8以下的爲不耐藥,爲8的認爲是耐藥。
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