如何在R中優雅地繪製相關係數矩陣機器學習
install.packages("psych") install.packages("corrplot")#安裝包,若是已安裝,請略過 library(psych) library(corrplot)#載入兩個包 data(iris)#機器學習經常使用神奇數據集——鳶尾花數據集 head(iris)#查看下數據集前五行 irisnew<-iris[,-5]#去除第五列種類變量 cormat<-corr.test(irisnew)#相關係數分析及顯著性檢驗 #最簡單的相關係數矩陣可視化 corrplot(cormat$r)
corrplot(cormat$r,method="square")
corrplot(cormat$r,method = "number")
corrplot(cormat$r,method = "shade")
corrplot(cormat$r,method="ellipse")
corrplot(cormat$r,method = "pie")
corrplot(cormat$r,method="square",type="lower",title = "Correlation of iris")
#含顯著性檢驗的相關係數矩陣可視化 cormatp<-cormat$p#單獨取出p值矩陣 cormatp[upper.tri(cormatp)]=0#設置p值矩陣上三角等於0 corrplot(cormat$r,method="square",type="lower",title = "Correlation of iris",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))
corrplot(cormat$r,method="square",type="full",title = "Correlation of iris",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))
corrplot.mixed(cormat$r,upper = "square",lower = "number",diag = "u",tl.cex=1.5,tl.pos = "lt",number.cex=1,p.mat=cormatp,sig.level=0.05,insig=c("pch"))