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GWAS中的genotype imputation簡介
時間 2021-07-14
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歡迎關注」生信修煉手冊」! GWAS用於尋找與疾病或者特定性狀相關聯的SNP位點,爲了更加有效的挖掘信息,GWAS需要大樣本量和高密度的SNP分型結果,最佳的分型方案當然是全基因組測序,然而成百上千個樣本的全基因組測序其成本依然是巨大的,目前更加經濟有效的方案是GWAS芯片,針對特定人羣,利用tag SNP的思想設計探針,覆蓋的SNP位點在幾十M的數量級。 相比全基因組測序,GWAS芯片確實更加經
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