hbase 學習（十四）Facebook針對hbase的優化方案分析

使用hbase的目的是爲了海量數據的隨機讀寫，可是在實際使用中卻發現針對隨機讀的優化和gc是一個很大的問題，並且hbase的數據是存儲在Hdfs，而Hdfs是面向流失數據訪問進行設計的，就不免帶來效率的降低。下面介紹一下Facebook Message系統在HBase online storage場景下的一個案例（《Apache Hadoop Goes Realtime at Facebook》, SIGMOD 2011），最近他們在存儲領域頂級會議FAST2014上發表了一篇論文《Analysis of HDFS Under HBase: A Facebook Messages Case Study》分析了他們在使用HBase中遇到的一些問題和解決方案。該論文首先講了Facebook的分析方法包括tracing/analysis/simulation，FM系統的架構和文件與數據構成等，接下來開始分析FM系統在性能方面的一些問題，並提出瞭解決方案。
FM系統的主要讀寫I/O負載

 

Figure 2描述了每一層的I/O構成，解釋了在FM系統對外請求中讀佔主導，可是因爲logging/compaction/replication/caching致使寫被嚴重放大。

• HBase的設計是分層結構的，依次是DB邏輯層、FS邏輯層、底層系統邏輯層。DB邏輯層提供的對外使用的接口主要操做是put()和get()請求，這兩個操做的數據都要寫到HDFS上，其中讀寫比99/1（Figure 2中第一條）。
• 因爲DB邏輯層內部爲了保證數據的持久性會作logging，爲了讀取的高效率會作compaction，並且這兩個操做都是寫佔主導的，因此把這兩個操做（overheads）加上以後讀寫比爲79/21（Figure 2中第二條）。
• 至關於調用put()操做向HBase寫入的數據都是寫入了兩份：一份寫入內存Memstore而後flush到HFile/HDFS，另外一份經過logging直接寫HLog/HDFS。Memstore中積累必定量的數據纔會寫HFile，這使得壓縮比會比較高，而寫HLog要求實時append record致使壓縮比（HBASE-8155）相對較低，致使寫被放大4倍以上。    Compaction操做就是讀取小的HFile到內存merge-sorting成大的HFile而後輸出，加速HBase讀操做。Compaction操做致使寫被放大17倍以上，說明每部分數據平均被重複讀寫了17次，因此對於內容不變的大附件是不適合存儲在HBase中的。因爲讀操做在FM業務中佔主要比例，因此加速讀操做對業務很是有幫助，因此compaction策略會比較激進。
  HBase的數據reliable是靠HDFS層保證的，即HDFS的三備份策略。那麼也就是上述對HDFS的寫操做都會被轉化成三倍的local file I/O和兩倍的網絡I/O。這樣使得在本地磁盤I/O中衡量讀寫比變成了55/45。
• 然而因爲對本地磁盤的讀操做請求的數據會被本地OS的cache緩存，那麼真正的讀操做是因爲cache miss引發的讀操做的I/O量，這樣使得讀寫比變成了36/64，寫被進一步放大。    另外Figure 3從I/O數據傳輸中真正業務需求的數據大小來看各個層次、各個操做引發的I/O變化。除了上面說的，還發現了整個系統最終存儲在磁盤上有大量的cold data（佔2/3），因此須要支持hot/cold數據分開存儲。

 

總的來講，HBase stack的logging/compaction/replication/caching會放大寫I/O，致使業務邏輯上讀爲主導的HBase系統在地層實際磁盤I/O中寫佔據了主導。
FM系統的主要文件類型和大小

FM系統的幾種文件類型如Table 2所示，這個是純業務的邏輯描述。在HBase的每一個RegionServer上的每一個column family對應一個或者多個HFile文件。FM系統中有8個column family，因爲每一個column family存儲的數據的類型和大小不同，使得每一個column family的讀寫比是不同的。並且不多數據是讀寫都會請求的，因此cache all writes可能做用不大（Figure 4）。

 

對於每一個column family的文件，90%是小於15M的。可是少許的特別大的文件會拉高column family的平均文件大小。例如MessageMeta這個column family的平均文件大小是293M。從這些文件的生命週期來看，大部分FM的數據存儲在large,long-lived files，然而大部分文件倒是small, short-lived。這對HDFS的NameNode提出了很大的挑戰，由於HDFS設計的初衷是爲了存儲少許、大文件準備的，全部的文件的元數據是存儲在NameNode的內存中的，還有有NameNode federation。
FM系統的主要I/O訪問類型下面從temporal locality, spatial locality, sequentiality的角度來看。
73.7%的數據只被讀取了一次，可是1.1%的數據被讀取了至少64次。也就是說只有少部分的數據被重複讀取了。可是從觸發I/O的角度，只有19%的讀操做讀取的是隻被讀取一次的數據，而大部分I/O是讀取那些熱數據。
在HDFS這一層，FM讀取數據沒有表現出sequentiality，也就是說明high-bandwidth, high-latency的機械磁盤不是服務讀請求的理想存儲介質。並且對數據的讀取也沒有表現出spatial locality，也就是說I/O預讀取也沒啥做用。
解決方案1. Flash/SSD做爲cache使用。

下面就考慮怎麼架構可以加速這個系統了。目前Facebook的HBase系統每一個Node掛15塊100MB/s帶寬、10ms尋址時間的磁盤。Figure 9代表：a)增長磁盤塊數有點用；b)增長磁盤帶寬沒啥大用；c)下降尋址時間很是有用。
因爲少部分一樣的數據會被常常讀取，因此一個大的cache可以把80%左右的讀取操做攔截而不用觸發磁盤I/O，並且只有這少部分的hot data須要被cache。那麼拿什麼樣的存儲介質作cache呢？Figure 11說明若是拿足夠大的Flash作二級緩存，cache命中率會明顯提升，同時cache命中率跟內存大小關係並不大。
注：關於拿Flash/SSD作cache，能夠參考HBase BucketBlockCache(HBASE-7404)

咱們知道你們比較關心Flash/SSD壽命的問題，在內存和Flash中shuffling數據可以使得最熱的數據被交換到內存中，從而提高讀性能，可是會下降Flash的壽命,可是隨着技術的發展這個問題帶來的影響可能愈來愈小。
說完加速讀的cache，接着討論了Flash做爲寫buffer是否會帶來性能上的提高。因爲HDFS寫操做只要數據被DataNode成功接收到內存中就保證了持久性（由於三臺DataNode同時存儲，因此認爲從DataNode的內存flush到磁盤的操做不會三個DataNode都失敗），因此拿Flash作寫buffer不會提升性能。雖然加寫buffer會使後臺的compaction操做下降他與前臺服務的I/O爭用，可是會增長很大複雜度，因此仍是不用了。最後他們給出告終論就是拿Flash作寫buffer沒用。
而後他們還計算了，在這個存儲棧中加入Flash作二級緩存不但能提高性能達3倍之多，並且只須要增長5%的成本，比加內存性價比高不少。
2.分層架構的缺點和改進方案

 

如Figure 16所示，通常分佈式數據庫系統分爲三個層次：db layer/replication layer/local layer。這種分層架構的最大優勢是簡潔清晰，每層各司其職。例如db layer只須要處理DB相關的邏輯，底層的存儲認爲是available和reliable的。
HBase是圖中a)的架構，數據的冗餘replication由HDFS來負責。可是這個帶來一個問題就是例如compaction操做會讀取多個三備份的小文件到內存merge-sorting成一個三備份的大文件，這個操做只能在其中的一個RS/DN上完成，那麼從其餘RS/DN上的數據讀寫都會帶來網絡傳輸I/O。
圖中b)的架構就是把replication層放到了DB層的上面，Facebook舉的例子是Salus，不過我對這個東西不太熟悉。我認爲Cassandra就是這個架構的。這個架構的缺點就是DB層須要處理底層文件系統的問題，還要保證和其餘節點的DB層協調一致，太複雜了。
圖中c)的架構是在a的基礎上的一種改進，Spark使用的就是這個架構。HBase的compaction操做就能夠簡化成join和sort這樣兩個RDD變換。

Figure 17展現了local compaction的原理，原來的網絡I/O的一半轉化成了本地磁盤讀I/O，並且能夠利用讀cache加速。咱們都知道在數據密集型計算系統中網絡交換機的I/O瓶頸很是大，例如MapReduce Job中Data Shuffle操做就是最耗時的操做，須要強大的網絡I/O帶寬。加州大學聖迭戈分校(UCSD)和微軟亞洲研究院(MSRA)都曾經設計專門的數據中心網絡拓撲來優化網絡I/O負載，相關研究成果在計算機網絡頂級會議SIGCOMM上發表了多篇論文，可是因爲其對網絡路由器的改動傷筋動骨，最後都沒有成功推廣開來。

 

Figure 19展現了combined logging的原理。如今HBase的多個RS會向同一個DataNode發送寫log請求，而目前DataNode端會把來自這三個RS的log分別寫到不一樣的文件/塊中，會致使該DataNode磁盤seek操做較多（再也不是磁盤順序I/O，而是隨機I/O）。Combined logging就是把來自不一樣RS的log寫到同一個文件中，這樣就把DataNode的隨機I/O轉化成了順序I/O。