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autodock-vina分子對接
時間 2021-01-22
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autodock-vina分子對接 1.蛋白質的處理 從蛋白庫裏獲取蛋白質的初始結構文件http://www.rcsb.org/ 這裏我們選用3HTB蛋白複合物文件,用可視化軟件打開pdb文件,這裏選用pymol軟件查看 我們去除掉水分子以及配體,在右側3htb中點A,選擇remove waters ,再點中右下角S,拖動序列欄,在序列欄中選中其他小分子配體,在右側sele中點A,選擇remove
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