NGS基礎 - 參考基因組和基因註釋文件

參考基因組和基因註釋文件獲取 通常測序生成的reads要與參考基因組或參考轉錄組進行比對，或Pseudo-alignment。所以首先需要獲取參考基因組和參考轉錄組信息。 Ensembl(http://www.ensembl.org/info/data/ftp/index.html)是常用的信息齊全的參考基因組和GTF文件下載網站。 下圖列出了幾個常用動物物種的DNA序列和GTF格式的基因組註釋。

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