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16s擴增子分析注意事項和經驗總結Tips
時間 2021-01-16
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個人1年多16s/ITS擴增子分析中積累的點點滴滴,此文適合新人瞭解相關零散知識,也適合有分析經驗的人交流與討論。 以下分析的經驗,是以測序數據類型爲Illumina HiSeq 2500產出的雙端250數據類型(PE250)爲基礎。 擴增測序技術選擇:推薦使用PE250,性價比超高; 原始數據使用fastqc質量評估,會發現數據右端末端質量較差,這是測序儀原理導致,我們在雙端合併時還會利用另一端
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