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16s rDNA數據分析經驗總結
時間 2021-01-07
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原文來自fanyucai博文,有修改和刪減。 去除嵌合體序列,推薦使用UCHIME 多樣性中,距離選擇現在包括兩種,一種是物種距離(Jaccard\Bray-Curtis);另一種是基於進化的距離(Unifrac),基於進化的距離還包含權重和非權重兩種,雖然含有進化信息但是,進化信息並不是越多越好,在結果呈現上,這兩種我們都應該關注結果。距離一般分爲離散和連續兩種,由於物種的分佈上,主要是離散的量
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